Publications Scientifiques

 

Publications scientifiques associées ou issues des projets financés par l'Académie 4 

2021

- M Chaves, L C. Gomes‐Pereira & J Roux.
Two-level modeling approach to identify the regulatory dynamics capturing drug response heterogeneity in single-cells. Scientific Reports 2021. In press

- A Sales de Queiroz, G Sales Santa Cruz, A Jean-Marie, D Mazauric, J Roux, F Cazals.
Gene prioritization based on random walks with restarts and absorbing states, to define gene sets regulating drug pharmacodynamics from single-cell analyses. Plos ONE XXXX. In revision.

- A John & M Rauzi.
A two-tier junctional mechanism drives simultaneous tissue folding and extension. Dev Cell 2021. DOI: 10.1016/j.devcel.2021.04.003.

- R Elaldi, P Hemon, L Petti, E Cosson, B Desrues, A Sudaka, G Poissonnet, E Van Obberghen-Schilling, J-O Pers, V M Braud, F Anjuère & A Meghraoui-Kheddar.
High Dimensional Imaging Mass Cytometry Panel to Visualize the Tumor Immune Microenvironment Contexture. Front Immunol 2021. DOI: 10.3389/fimmu.2021.666233

- C Cansell, K Stobbe, C Sanchez, O Le Thuc, C A Mosser, S Ben-Fradj, J Leredde, C Lebeaupin, D Debayle, L Fleuriot , F Brau, N Devaux, A Benani, E Audinat, N Blondeau, J-L Nahon, C Rovère.
Dietary fat exacerbates postprandial hypothalamic inflammation involving glial fibrillary acidic protein-positive cells and microglia in male mice. Glia 2021. DOI: 10.1002/glia.23882.

- A S Rousseau, J Murdaca, G Le Menn, B Sibille, W Wahli, S Le Garf, G Chinetti, J G Neels & I Mothe-Satney. 
Invalidation of the Transcriptional Modulator of Lipid Metabolism PPARb/d in T Cells Prevents Age-Related Alteration of Body Composition and Loss of Endurance Capacity. Frontiers in Physiology 2021. DOI: 10.3389/fphys.2021.587753.

- E Macia, M Vazquez-Rojas, A Robiolo, R Fayad, S Abélanet, I Mus-Veteau, F Fontaine-Vive, M Mehiri, F Luton & M Franco. 
Chlortetracycline, a Novel Arf Inhibitor That Decreases the Arf6-Dependent Invasive Properties of Breast Cancer Cells. Molecules 2021. DOI: 10.3390/molecules26040969.

- Mantegazza M, Cestèle S & Catterall W.
Sodium Channelopathies of Skeletal Muscle and Brain. Physiol Rev. 2021. DOI: 10.1152/physrev.00025.2020.

-P Ávalos Prado, S Häfner, Y Comoglio, B Wdziekonski, C Duranton, B Attali, J Barhanin & G Sandoz. 
KCNE1 is an auxiliary subunit of two distinct ion channel superfamilies. Cell 2021. DOI: 10.1016/j.cell.2020.11.047.

- Caillard S, Chavarot N, Francois H, Matignon M, Greze C, Kamar N, Gatault P, Thaunat O, Legris T, Frimat L, Westeel PF, Goutaudier V, Jdidou M, Snanoudj R, Colosio C, Sicard A, Bertrand D, Mousson C, Bamoulid J, Masset C, Thierry A, Couzi L, Chemouny JM, Duveau A, Moal V, Blancho G, Grimbert P, Durrbach A, Moulin B, Anglicheau D, Ruch Y, Kaeuffer C, Benotmane I, Solis M, LeMeur Y, Hazzan M & Danion F.
 Is COVID-19 infection more severe in kidney transplant recipients? French SOT COVID Registry.Am J Transplant. 2021. DOI: 10.1111/ajt.16424.

- Millington JW, Brownrigg GP, Chao C, Sun Z, Basner-Collins PJ, Wat LW, Hudry B, Miguel-Aliaga I & Rideout EJ.
Female-biased upregulation of insulin pathway activity mediates the sex difference in Drosophila body size plasticity. Elife. 2021. DOI: 10.7554/eLife.58341.

- Popkova A, Rauzi M & Wang X.
Cellular and Supracellular Planar Polarity: A Multiscale Cue to Elongate the Drosophila Egg Chamber. Front Cell Dev Biol. 2021. DOI: 10.3389/fcell.2021.645235. 

2020

- A Hasanovic, M Simsir, C Fs, E Lalli & I Mus-Veteau.
Astemizole Sensitizes Adrenocortical Carcinoma Cells to Doxorubicin by Inhibiting Patched Drug Efflux Activity. Biomedicines 2020. DOI: 10.3390/biomedicines8080251.

- C Verkest, S Häfner, P A Prado, A Baron & G Sandoz.
Migraine and Two-Pore-Domain Potassium Channels. The Neuroscientist 2020. DOI: 10.1177/1073858420940949.

- D Douguet & F Payan.
SENSAAS: Shape‐based Alignment by Registration of Colored Point‐based Surfaces. Molecular Informatics 2020. DOI: 10.1002/minf.202000081.

- J Gilleron, C Meziat, A Sulen, S Ivanov, J Jager, D Estève, C Muller, J-F Tanti & M Cormont.
Exploring Adipose Tissue Structure by Methylsalicylate Clearing and 3D Imaging. JoVE 2020. DOI: 10.3791/61640.

- J Gilleron, T Goudon, F Lagoutière, H Martin, B Mauroy, P Millet, M Ribot & C Vaghi.
Modeling and analysis of adipocytes dynamic with a differentiation process. ESAIM PROCS 2020. DOI: 10.1051/proc/202067013.

- L Signetti, N Elizarov, M Simsir, A Paquet, D Douguet, F Labbal, D Debayle, A Di Giorgio, V Biou, C Girard, M Duca, L Bretillon, C Bertolotto, B Verrier, S Azoulay & I Mus-Veteau.
Inhibition of Patched Drug Efflux Increases Vemurafenib Effectiveness against Resistant BrafV600E Melanoma. Cancers (Basel) 2020. DOI:10.3390/cancers12061500.

- L Vaillant-Beuchot, A Mary, R Pardossi-Piquard, A Bourgeois, I Lauritzen, F Eysert, P F Kinoshita, J Cazareth, C Badot, K Fragaki, R Bussiere, C Martin, R Mary, C Bauer, S Pagnotta, V Paquis-Flucklinger, V Buée-Scherrer, L Buée, S Lacas-Gervais, F Checler & M Chami. 
Accumulation of amyloid precursor protein C-terminal fragments triggers mitochondrial structure, function, and mitophagy defects in Alzheimer's disease models and human brains. Acta Neuropathol 2020. DOI: 10.1007/s00401-020-02234-7.

- M Simsir, I Broutin, I Mus‐Veteau & F Cazals.
Studying dynamics without explicit dynamics: A structure-based study of the export mechanism by AcrB. Proteins 2020. DOI: 10.1002/prot.26012.

- Monjo F, Zory R & Forestier N. Fatiguing Neuromuscular Electrical Stimulation Decreases the Sense of Effort During Subsequent Voluntary Contractions in Men.
Neuroscience 2020. DOI: 10.1016/j.neuroscience.2020.08.036.

- I Bassani, C Rancurel, S Pagnotta, F Orange, N Pons, K Lebrigand, F Panabières, L Counillon, X Noblin & E Galiana.
Transcriptomic and Ultrastructural Signatures of K ⁺-Induced Aggregation in Phytophthora parasitica Zoospores. Microorganisms 2020. DOI: 10.3390/microorganisms8071012.

- Sicard A, Kanitakis J, Dubois V, Morelon E & Thaunat O.
Humoral Alloreactivity in VCA Recipients: Should We Learn From Our Experience? Transplantation. 2020. DOI: 10.1097/TP.0000000000003164.

- Sicard A, Lamarche C, Speck M, Wong M, Rosado-Sánchez I, Blois M, Glaichenhaus N, Mojibian M & Levings MK.
Donor-specific chimeric antigen receptor Tregs limit rejection in naive but not sensitized allograft recipients. Am J Transplant. 2020. DOI: 10.1111/ajt.15787.

- Harayama T & Shimizu T.
Roles of polyunsaturated fatty acids, from mediators to membranes. J Lipid Res. 2020. DOI: 10.1194/jlr.R120000800.

- Harayama T.
Membrane Biology: Transmembrane Helices Need to Fit the Surrounding Fat. Curr Biol. 2020. DOI: 10.1016/j.cub.2019.12.010.

- Rauzi M.
Cell intercalation in a simple epithelium. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 2020. DOI: 10.1098/rstb.2019.0552.

- Popkova A, Stone OJ, Chen L, Qin X, Liu C, Liu J, Belguise K, Montell DJ, Hahn KM, Rauzi M & Wang X.
A Cdc42-mediated supracellular network drives polarized forces and Drosophila egg chamber extension. Nat Commun. 2020. DOI: 10.1038/s41467-020-15593-2.

- De Medeiros G, Kromm D, Balazs B, Norlin N, Günther S, Izquierdo E, Ronchi P, Komoto S, Krzic U, Schwab Y, Peri F, de Renzis S, Leptin M, Rauzi M & Hufnagel L.
Cell and tissue manipulation with ultrashort infrared laser pulses in light-sheet microscopy. Sci Rep. 2020. DOI: 10.1038/s41598-019-54349-x.

- D A Adekunle & A Hubstenberger.
The multiscale and multiphase organization of the transcriptome. Emerg Top Life Sci 2020. DOI: 10.1042/ETLS20190187.

- Duffraisse M, Paul R, Carnesecchi J, Hudry B, Banreti A, Reboulet J, Ajuria L, Lohmann I & Merabet S.
Role of a versatile peptide motif controlling Hox nuclear export and autophagy in the Drosophila fat body. J Cell Sci. 2020. DOI: 10.1242/jcs.241943.

- El Maï M, Marzullo M, de Castro IP & Ferreira MG. 
Opposing p53 and mTOR/AKT promote an in vivo switch from apoptosis to senescence upon telomere shortening in zebrafish. Elife 2020. DOI: 10.7554/eLife.54935.

- Lex K, Maia Gil M, Lopes-Bastos B, Figueira M, Marzullo M, Giannetti K, Carvalho T & Ferreira MG. 
Telomere shortening produces an inflammatory environment that increases tumor incidence in zebrafish. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020. DOI: 10.1073/pnas.1920049117.

- A Joly, J Soltys, A Gallet & R Rousset.
Impact des bio-insecticides à base de Bacillus thuringiensis sur le développement de cancers de l’intestin. Médecines / Sciences 2020. DOI: 10.1051/medsci/2020192.

 

2019

- Silva PM, Puerner C, Seminara A, Bassilana M & Arkowitz RA.
Secretory Vesicle Clustering in Fungal Filamentous Cells Does Not Require Directional Growth. Cell Rep. 2019. DOI: 10.1016/j.celrep.2019.07.062.

- B Hudry, E de Goeij, A Mineo, P Gaspar, D Hadjieconomou, C Studd, J B Mokochinski, Holger. Kramer, P-Y Placais, T Preat & I Miguel-Aliaga.
Sex Differences in Intestinal Carbohydrate Metabolism Promote Food Intake and Sperm Maturation. Cell 2019. DOI: 10.1016/j.cell.2019.07.029.

- Romero-Pozuelo J, Foronda D, Martín P, Hudry B, Merabet S, Graba Y & Sánchez-Herrero E.
Cooperation of axial and sex specific information controls Drosophila female genitalia growth by regulating the Decapentaplegic pathway. Dev Biol 2019. DOI: 10.1016/j.ydbio.2019.06.014.

- F De Graeve, E Debreuve, S Rahmoun, S Ecsedi, A Bahri, A Hubstenberger, X Descombes & F Besse.
Detecting and quantifying stress granules in tissues of multicellular organisms with the Obj.MPP analysis tool. Traffic 2019. DOI: 10.1111/tra.12678.

- Courel M, Clément Y, Bossevain C, Foretek D, Vidal Cruchez O, Yi Z, Bénard M, Benassy MN, Kress M, Vindry C, Ernoult-Lange M, Antoniewski C, Morillon A, Brest P, Hubstenberger A, Roest Crollius H, Standart N & Weil D.
GC content shapes mRNA storage and decay in human cells. Elife. 2019. DOI: 10.7554/eLife.49708.

- D Douguet & F Payan.
SENSAAS (SENsitive Surface As A Shape): utilizing open-source algorithms for 3D point cloud alignment of molecules. arXiv 2019. DOI: arXiv:1908.11267 [q-bio.BM].

- Deshayes M, Clément-Guillotin C, Zory R.
Men are Better Than Women!" The Positive Effect of a Negative Stereotype Toward Women on a Self-Paced Cycling Exercise. J Sport Exerc Psychol 2019. DOI: 10.1123/jsep.2018-0213.
 

2018

- Y Zhou, J-B Caillau, M Antonini & M Barlaud. 
Robust classification with feature selection using alternating minimization and Douglas-Rachford splitting method. ArXiv 2018. https://www.i3s.unice.fr/~barlaud/arxiv_2018.pdf

- Grmai L, Hudry B, Miguel-Aliaga I, Bach EA.
Chinmo prevents transformer alternative splicing to maintain male sex identity. PLoS Genet. 2018. DOI: 10.1371/journal.pgen.1007203.
 

2017

- Hubstenberger A, Courel M, Bénard M, Souquere S, Ernoult-Lange M, Chouaib R, Yi Z, Morlot JB, Munier A, Fradet M, Daunesse M, Bertrand E, Pierron G, Mozziconacci J, Kress M & Weil D. 
P-Body Purification Reveals the Condensation of Repressed mRNA Regulons. Mol Cell. 2017 Oct 5;68(1):144-157.e5. DOI: 10.1016/j.molcel.2017.09.003.
 

 

Publications Scientifiques des Unités de Recherche d'Université Côte d'Azur

HAL d'Azur et d'IDEX JEDI

L'Université Côte d'Azur gère et valorise la production scientifique de ses chercheurs ici : https://hal.univ-cotedazur.fr/

Les publications issues des projets financés par l'IDEX^JEDI sont répertoriées ici : https://hal.archives-ouvertes.fr/IDEX-UNIV-COTEDAZUR

L'archive ouverte HAL est destinée au dépôt et à la diffusion d'articles scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, dans toutes les disciplines.

Signature scientifique d'Université Côte d'Azur

Depuis le 1er juillet 2016, toutes les publications et productions issues des laboratoires, équipes de recherche ou de création d’Université Côte d’Azur doivent porter la signature commune des membres d’Université Côte d’Azur.

L’usage de cette signature conditionne notamment la reconnaissance d’Université Côte d’Azur par la communauté des pairs et sa présence dans les classements internationaux.

Le détail ici : SIGNATURE SCIENTIFIQUE
 

Signature des publications issues des projets soutenus par l’IDEXJEDI d'Université Côte d'Azur

Outre le respect de la signature scientifique Université Côte d'Azur, les publications et communications issues des projets financés en tout ou partie par l’IDEX UCA^JEDI doivent porter la mention :

"Ce travail a bénéficié d'une aide du gouvernement français, gérée par l'Agence Nationale de la Recherche au titre du projet Investissements d’Avenir UCA^JEDI portant la référence n° ANR-15-IDEX-01".
 

Programme "La Science Ouverte"

Le Plan National pour la Science Ouverte promeut la diffusion sans entrave des publications et des données de la recherche.
Elle vise à construire un écosystème dans lequel la science sera plus cumulative, plus fortement étayée par des données, plus transparente, plus rapide et d’accès universel.
Elle est fondée sur l’opportunité que représente la mutation numérique pour développer l’accès ouvert aux publications et, autant que possible, aux données de la recherche.

De nombreuses ressources sont disponibles ici.

Parmi les plus demandées:

Passeport pour les doctorants : un guide conçu pour accompagner les doctorants à chaque étape de leur parcours de recherche, quel que soit leur champ disciplinaire. Il propose une série de bonnes pratiques et d’outils directement activables.

Je publie, quels sont mes droits ? Le guide liste les questions que doivent se poser les auteurs de publications scientifiques lorsqu'ils décident de publier leurs travaux. Il donne des conseils et des options possibles à appliquer tout au long du processus de publication.