STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES
En Mai 2023, 11 projets de recherche ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2023, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 6 projets à financer en 2023 ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.
Projet 2023_1.1 : FRAMBOMIX-S - A multi-OMICs integrating analysis for a global comprehension of splicing alterations in the etiology of the Fragile-X Syndrome Porteur 1 : Carole GWIZDEK gwizdek@ipmc.cnrs.fr Bio IPMC
Porteur 2 : Silvia BOTTINI Silvia.BOTTINI@univ-cotedazur.fr Maths & Informatique MSI Mots clés : Fragile-X Syndrome, multi-OMICs integrating analysis, FMRP nuclear functions, mRNA splicing, bioinformatics, variational autoencoders, machine learning
Projet 2023_1.2 : MathArchi - Caractérisation de l’architecture de la lame basale par analyses mathématiques d’images 3D Porteur 1 : Frédéric LUTON luton@ipmc.cnrs.fr Bio IPMC
Porteur 2 : Xavier DESCOMBES xavier.descombes@inria.fr Informatique INRIA Mots clés : invasion, lame basale, architecture, reconstruction 3D, analyses d’images, apprentissage machine
Projet 2023_1.3 : CCQ - Characterization and quantification of cell geometry and topology changes in urchin invagination Porteur 1 : Matteo RAUZI Matteo.RAUZI@univ-cotedazur.fr Bio IBV
Porteur 2 : Gregoire MALANDAIN Gregoire.Malandain@inria.fr Informatique INRIA Partenaires : CROCE/Jennifer.croce@imev-mer.fr / Bio LBDV
Projet 2023_1.5 : I-serpine1 - Développement d’inhibiteurs de la serpine1 pour le traitement du cancer du rein Porteur 1 : Maeva DUFIES maeva.dufies@unice.fr Bio IRCAN
Porteur 2 : Cyril RONCO cyril.ronco@unice.fr Chimie ICN Mots clés : Serpine1, développement de petites molécules chimiques, nouvelle stratégie thérapeutique, Renal Cell Carcinoma (RCC)
Projet 2023_1.8 : KillRab - Identify compounds able to repress the Rab-dependent negative feedback loop on PPAR transcription to improve MAFLD therapies Porteur 1 : GILLERON Jérôme Jerome.GILLERON@univ-cotedazur.fr Bio C3M
Porteur 2 : TOPIN Jérémie Jeremie.TOPIN@univ-cotedazur.fr Chimie ICN Mots clés : Rab protein / chemical structure / inhibitor / MAFLD / Liver
Projet 2023_1.11 : Chemometric_RNP - Use of Chemometric Approaches to improve drug synthesis targeting Processing bodies Porteur 1 : Patrick Brest Patrick.Brest@univ-cotedazur.fr Bio IRCAN
Porteur 2 : Christophe Di Giorgio Christophe.Di-Giorgio@univ-cotedazur.fr Chimie ICN Partenaires : Rete/ Tifenn.Rete@etu.univ-cotedazur.fr, Nicolini/ Victoria.Nicolini@hotmail.fr, Duca/ Maria.Duca@univ-cotedazur.fr Mots clés : Processing bodies, biocondensats, criblage chimique, machine learning, approches chimiométriques
Action 3
ANIMATION SCIENTIFIQUE
En Mai 2023, 4 projets de conférence ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juillet 2023, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 3 projets de séminaires ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.
Projet 2023_3.2 : JOBIM2023 - Conférence « JOBIM'23 IN NICE » Porteur 1 : Karine Robbe Sermesant karine.robbe-sermesant@inrae.fr Bio INRAE Porteur 2 : Olivier Croce olivier.croce@univ-cotedazur.fr Bio IRCAN Partenaires : Edoardo Sarti edoardo.sarti@inria.fr INRIA / Da Rocha Martine Martine.da-rocha@inrae.fr INRAE / Bottini Silvia silvia.bottini@univ-cotedazur.fr MDLab MSI / Bécavin Christophe becavin@ipmc.cnrs.fr IPMC / Gautier Romain gautier@ipmc.cnrs.fr IPMC / Bailly-Bechet Marc marc.bailly-bechet@inrae.fr INRAE Mot clés : Transdisciplinaire, Biologie, Mathématiques, Informatique, Bioinformatique, Omiques
Projet 2023_3.3 : ICAWL - Collaboration / Visiting Scientist : New tools for investigation of pH-dependent mechanisms of plant oomycete interactions (collaboration between INRAE, Université Côte d’Azur and Wageningen University Laboratories)
Porteur 1 : Eric Galiana eric.galiana@inrae.fr Bio INRAE
Porteur 2 : Agnès Attard agnes.attard@inrae.fr Bio INRAE
Partenaires : Carlotta Lupatelli Carlotta lupatelli@inrae.fr Bio INRAE / Edouard Evangelisti edouard.evangelisti@wur.nl Wageningen University NL Mots clés : Plant disease, Oomycete, Interaction, Infection, pH, Franco-Dutch collaborations
Projet 2023_3.4 : Nice-seq - An interactive genomic forum of the Nice bay area
Porteur 1 : Gianni Liti gianni.liti@unice.fr Bio IRCAN
Porteur 2 : Chiara Vischioni cvischioni@unice.fr Bio IRCAN
Mots clés : genomics, bioinformatics, computational biology, quantitative biology, molecular
evolution, multi-omics
En Sept 2023, 5 nouveaux projets de conférence ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 4 membres du conseil scientifique de l'Académie.
Fin sept 2023, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 4 projets de conférences ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.
Projet 2023_3.5 : RFRD -19e Symposium du Réseau Français de Recherche sur le Douleur - 12-13 avril 2024 Porteur 1 : Eric LINGUEGLIA lingueglia@ipmc.cnrs.fr Bio IPMC
Mots clés : douleur, réseau, national, international, recherche fondamentale, recherche clinique, symposium
Projet 2023_3.6 : COCOO - Colloque et conférences de l’OMCNC (L’Observatoire des Médecines Complémentaires Non Conventionnelles) Porteur 1 : Véronique MONDAIN mondain.v@chu-nice.fr Médecin CHU
Porteur 2 : Alice GUYON alice.guyon@ipmc.cnrs.fr Bio shs Marseille
Mots clés : Interventions non médicamenteuses, pratiques complémentaires, médecine intégrative, colloque, conférence, formation, enseignement, recherche
Projet 2023_3.7 : DEVAGE - EMBO workshop “Developmental Circuits in Aging” - 9 - 12 avril 2024, NICE, FRANCE Porteur 1 : Eric GILSON eric.gilson@univ-cotedazur.fr, Bio IRCAN
Mots clés : Ageing, development, workshop, age-related diseases, biomedicine, ecophysiology, cell and molecular biology, stem cell, regeneration, genome maintenance, cell senescence.
Projet 2023_3.8 : BioIAS 2nd Edition - Second edition of the Biological Image Processing and Analysis - Fevrier 2024 Porteur 1 : Ellen VAN OBBERGHEN-SCHILLING Ellen.VAN-OBBERGHEN@univ-cotedazur.fr Bio iBV
Porteur 2 : Laure BLANC-FERAUD blancf@i3s.unice.fr Informatique Laboratoire I3S
Mots clés : biological images, quantitative image analysis, microscopy, experimental and computational scientists
Action 4
INFRASTRUCTURE PARTAGEE
Projet 2023 : ODIN - Omics Data Integration Network
Porteur : Lebrigand Kevin lebrigand@ipmc.cnrs.fr
Partenaires : Olivier CROCE, Luc MARTIN, Corinne RANCUREL
Mots Clés : Analyse, bioinformatique, statistique, réseau, génomique, protéomique, multi-omique Objectifs : Mise en place d’un portail web de gestion et de sauvegarde des analyses bioinformatiques de données de biologie quantitative « omics » produites par les plateaux technologiques et les équipes de recherche du réseau d’Université Côte d’Azur.
Action 5
THESES INTERDISCIPLINAIRES
Thèse cofinancée par Académie 4 - EUR LIFE : Adèle RIVAULT
Projet 3_2 : AWW - « L’anthracologie dans le monde : diversité des contextes et des milieux. Applications, limites et avancées » / “Anthracology WorldWide: diversity of contexts and environments. Applications, limits and advances”.
Porteur : Elysandre PUECH / archéobotanique / SJA3 - CEPAM / elysandre.puech@cepam.cnrs.fr Mot clés : Anthracologie, Méthodologie, Paléobiodiversité, Paléoenvironnement.
Projet 3_3 : GERLI - 17th International GERLI Lipidomics Meeting : ‘’Lipids: from membrane dynamics to signaling’’
Porteur : Amri Ez-ZOUBIR / Bio / IBV / ez-zoubir.amri@univcotedazur.fr - Gérard Lambeau / Bio / IPMC / Gerard.LAMBEAU@univ-cotedazur.fr Mot clés : Lipides, métabolisme et signalisation, nutrition, cancer, maladies métaboliques, inflammation, immunologie, microbiote, infection.
Projet 3_5 : CRISPR-DAY - One Day Meeting : CRISPR Screening in Cancer Discovery
Porteur : Bernard MARI / Bio / IPMC / Bernard.MARI@univ-cotedazur.fr Mot clés : Crible CRISPR / Cas 9, Génomique Fonctionnelle, Cancérologie, Bioinformatique.
Projet 3_6 : BAW@UCA - Semaine du Cerveau sur la Côte d'Azur
Porteur : C Rovere et J Noël / Biologie / iPMC / rovere@ipmc.cnrs.fr Mots clés : Cerveau, culture scientifique, partenaire UCA, interdisciplinarité.
Projet 3_7 : SDS#23 - Semaine du Son de l’Unesco NICE 2023
Porteur : Renaud DAVID / Santé / CHU Université Côte d’Azur / renaud.david@univ-cotedazur.fr Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement.
2021
Action 1
STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES
Projet 2021_1 Kill_HIF - A novel antagonist of HIF-1alpha to target cancer. Nathalie MAZURE, mazure@unice.fr, DR2 CNRS / Biologie / INSERM U1065, C3M / 1 Master. Mohamed MEHIRI, Mohamed.mehiri@univ-cotedazur.fr, MCU HDR / Chimie / ICN / 1 Master.
Frédéric BOST.
Mots clés : Cancer, Inhibiteur, HIF-1, Hypoxie, Substances naturelles marines.
Projet 2021_2 RNP_IMAGE - Developing methodologies to quantitatively analyze RNP granule dynamic properties upon aging. Florence BESSE, Florence.besse@univ-cotedazur.fr / Biologie / iBV / 1 Master. Xavier DESCOMBES, xavier.descombes@inria.fr / Informatique / INRIA / 1 Master.
Fabienne DE GRAEVE & Eric DEBREUVE.
Mots clés : biological condensates, RNP granules, high-resolution live imaging, automatic object detection, quantitative image analysis.
Projet 2021_4 Chemi_RNP - Optimisation de composés chimiques ciblant les granules à ARN. Patrick BREST, patrick.brest@univ-cotedazur.fr / CRCN INSERM / Biologie / IRCAN / 1 Master. Maria DUCA, maria.duca@univ-cotedazur.fr / CRCN CNRS / Chimie / ICN / 1 Master.
NICOLINI Victoria, JACQUET Karine & Di Giorgio Audrey.
Mots clés : Granules à ARN, Processing bodies, ribonucléoproteine, criblage chimique.
Projet 2021_5 PROoF - Comment protéger les forêts marines Méditerranéennes des poissons herbivores ? (PROtection of marine forests from herbivorous Fishes). Luisa PASSERON-MANGIALAJO, Luisa.PASSERON-MANGIALAJO@univ-cotedazur.fr / MCF HC HDR / Ecologie fonctionnelle / ECOSEAS / 1 Master. Nathalie LAZARIC, Nathalie.LAZARIC@univcotedazur.fr / DR CNRS / Economie / GREDEG / 1 Master.
Cécile SABOURAULT & Mohamed MEHIRI.
Mots clés : forêts marines, poissons herbivores, écologie chimique, changements de comportements des consommateurs, valorisation économique, gouvernance des écosystèmes, biens communs.
Projet 2021_6 AmpFluo3D - Solution innovante d’AMPlification de la FLUOrescence appliquée à la détection de marqueurs sur cultures cellulaires tridimensionnelles. Frédéric BRAU, brau@ipmc.cnrs.fr / IR HC CNRS / Biologie / IPMC / 1 Master. Tatiana BUDTOVA, tatiana.budtova@mines-paristech.fr DR / Physiques / Mines ParisTech / 1 Master.
LIPPI Gian Luca & LUTON Frédéric.
Mots clés : Imagerie cellulaire, Culture 3D, Bio-aérogels, Polysaccharides, diffusion de la lumière, Fluorescence.
Action 2
COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR
Installation en Janvier 2021 au Laboratoire de Physio Médecine Moléculaire (LP2M), UMR7370 CNRS, Université Côte d’Azur, NICE, de la nouvelle équipe ATIP Avenir : TNT - Recherche Translationelle en Néphrologie et Transplantation.
L'équipe est dirigée par :
Antoine SICARD, MD, PhD
Co-responsable Équipe de recherche clinique INNOVANT Immunomonitoring et thérapies Innovantes en Auto-immunité, Néphrologie et Transplantation, Unité de Recherche Clinique Côte d’Azur (UR2CA) Université Côte d’Azur
Praticien Hospitalier Universitairedu Service de néphrologie-dialyse-transplantation, Hôpital Pasteur II, CHU de Nice
En provenance de :
Equipe du Pr Levings, Surgery department, BCCHRI, University of British Columbia, Vancouver, Canada
Equipe du Pr Glaichenhaus, IPMC, UMR 7275, CNRS, Sophia Antipolis
Project : IPRAM - Innovative immunotherapeutic procedures for preventing antibody-mediated rejection in transplant candidates Objectives: to reduce the risk of rejection and infection in HLA-sensitized transplant patients by selectively targeting anti-HLA antibody-producing B cells.
Key words : kidney transplantation, antibody-mediated rejection, desensitization, immunotherapy, cell therapy, chimeric antigen receptor T cells Website: http://unice.fr/lp2m/fr
Action 3
ANIMATION SCIENTIFIQUE
Ces séminaires ont été reportées en 2021 pour des raisons de crise sanitaire due au CoViD-19.
Projet 3_2 : 31CCI - 31è Colloque Canaux Ioniques
Porteur : Sylvie DIOCHOT / Biologie / IPMC CNRS UMR7275
Lieu et dates : Sète, reporté en 2022
Mot clés : canaux ioniques, neurophysiologie, cardiologie, électrophysiologie, échange d’informations scientifiques (étudiants doctorants, post-doctorants, chercheurs)
Projet 3_3 : JMLC - 3rd Joint Meeting on Lung Cancer
Porteur : Paul HOFMAN / Santé / IRCAN INSERM CHU Hôpital Pasteur 1
Lieu et dates : Nice, reporté en 2022
Mots clés : Cancer du poumon, Biomarqueurs, OncoAge, MD Anderson
Projet 3_5 : SDS_2021 - Semaine du Son de l’Unesco NICE 2021
Porteur : Renaud DAVID / Santé / CMRR CHU Université Côte d’Azur
Lieux et dates : Pasteur 2 Amphithéâtre GALET, NICE et en visioconférence, 5 au 12 juin 2021
Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement
Photos et Vidéos ici : Semaine du Son de l’Unesco NICE 2021
2020
Action 1
STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES
Projet 1_1 : ADOLYS - Adressage d’oncogènes au lysosome grâce à des molécules chimères de synthèse Guillaume ROBERT / Biologie / C3M / 1 M2 Anthony MARTIN / Chimie / ICN / 1 M2
Mots clés : CMA, Molécule chimère, Lysosome, Oncogène, Hémopathies Myéloïdes, Ligation-Chimique, Bio-Conjugaison
Projet 1_3 : DARKtoLiGHT - Development of DRET-based fluorogenic probes for imaging of RNA subcellular distribution Florence BESSE / Biologie / iBV / 1 M2 Benoît MICHEL / Chimie / ICN / 1 M2
Partenaires : Fabienne DE GRAEVE, Alain BURGER
Mots clés : Subcellular RNA localization, Compartmentalization, RNP granules, S/N ratio, fluorogenic probes, push–pull fluorophores, RNA detection, 2-photon imaging
Projet 1_4 : Hyp-ATACK - Hypusination targeting of cancer Frédéric BOST / Biologie / C3M / M2 Mohamed MEHIRI / Chimie / ICN / M2
Partenaires : Victor TIROILLE, Kathiane LAURENT
Mots clés : Cancer, Hypusination, Substances naturelles marines, Composés de synthèse, Polyamines, Métabolomique
Projet 1_5 : TREAT-X – Identification of new therapeutics to treat Fragile X Syndrome and autism Maria CAPOVILLA / Biologie / IPMC / M2 Maria DUCA / Chimie / ICN / M2
Partenaires : Barbara BARDONI, Marielle JARJAT, Audrey Di GIORGIO.
Mots clés : Fragile X Syndrome, therapy, RNA-binding, mass-spectrometry, blood-brain-barrier
Projet 1_6 : PRO-ZOOM – Impact of the PROton flux emitted by roots in the rhizosphere on ZOOspores Motion Agnès ATTARD / Biologie / ISA INRAE / M2 Philippe THOMEN / Physique / INPHYNI / M2
Partenaires : Eric GALIANA; Joelle Le BERRE; Naïma MINET; Catherine MURA; Céline COHEN; Xavier NOBLIN
Mots clés : Microfluidic device, plant pathology, proton pumps, Arabidospis, zoospore motion, attraction, ionic gradient.
Projet 1_8 : MASCOT - Machine-learning et analyse des mouvements collectifs chez les trichogrammes Louise VAN OUDENHOVE / Biologie / ISA INRAE / M2 François BREMONT / Informatique / INRIA / M2
Partenaires : Vincent CALCAGNO; Guy PEREZ; Monique THONNAT
Mots clés : Trichogramma; interactions sociales; mouvement collectif; intelligence artificielle; analyse d’images; algorithmes d’apprentissage
Projet 1_9 : SYNCHRO - Modélisation mathématique et outils expérimentaux pour l’étude du couplage intercellulaire entre oscillateurs circadiens de cellules périphériques Madalena CHAVES / Informatique / INRIA / M2 Michèle TEBOUL / Biologie / iBV / M2
Partenaires : Firippi Eleni; Nicolas Augier; Delaunay Franck; Guérin Sophie; Monterosso Baptiste
Mots clés : Modèles linéaires par morceaux, couplage, synchronisation, oscillateur circadien
Projet 1_10 : SeizPred - Novel AI approach for seizure prediction in mouse models Massimo MANTEGAZZA / Biologie / IPMC / M2 Marco LORENZI / Informatique / INRIA / M2
Partenaires : Fabrice DUPRAT, Fabrizio CAPITANO, Etrit HAXHOLLI, Carlo FANARA
Mots clés : Artificial intelligence algorithms, seizure prediction, epileptic encephalopathies, closed loop stimulation, risk modeling, time series analysis, therapeutic strategies
Projet 1_11 : LeftRightReliable - Reliable signalling in heterogeneous biological objects: The case of the zebrafish Left-Right Organizer Maximilian FÜRTHAUER / Biologie / IBV / M2 Xavier DESCOMBES / Informatique / i3S INRIA / M2
Partenaires : Sophie POLES, Renaud REBILLARD
Mots clés : Left-Right asymmetry, Cell Signalling, Biological noise, Zebrafish
Action 2
COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR
Installation en Août 2020 à l’IPMC, SOPHIA ANTIPOLIS, d’une nouvelle équipe ATIP dirigée par
Takeshi HARAYAMA, PhD, de l’UNIGE (SUISSE)
Projet :FACiL - Functions of Acyl-Chains in Lipid Membranes
Objectifs
Search for the function of glycerophospholipids (GPLs) Acyl Chains at the molecular level in mammalian cells through two major projects : Project 1: Molecular mechanisms linking linoleic acid-rich GPLs to adipogenesis. Project 2: Relationship between acyl-chain asymmetry and phase separation.
STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES
Projet 1 : MOORPHEUS - Modélisation computationnelle de la croissance et de l’organisation spatiale dynamique des organoïdes / tumoroïdes de prostate Stephan Clavel / Biologie / C3M INSERM / 1 Master Xavier Descombes / Informatique / INRIA / 1 Master Frédéric Bost/ Biologie / C3M
Mots clés : Modélisation computationnelle, organoïdes, analyse d’image, simulation numérique, prostate,cancer, culture cellulaire 3D
Projet 2 : Sensaas - Sensitive surface as a shape : Calcul de la similarité moléculaire par comparaison de formes 3D à des fins de criblage virtuel Dominique Douguet / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master Frédéric Payan / Informatique / i3S UNS / 1 Master Marc Antonini / Informatique / i3S UNS
Mots clés : Enveloppe moléculaire ; Similarité ; Criblage virtuel ; Recalage de nuages de points ; Apprentissage profond
Projet 4 : MCSPegylation - Entropic barriers to control protein movements at membrane contact sites Bruno Antonny / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master Alain Burger / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Instrinsically unstructured region, Membrane contact site, Click chemistry, Protein PEGylation
Projet 5 : PatchedChemoBio - Inhibition of Ptch1 chemotherapy resistance activity : cellular and chemical approaches Isabelle Mus-Veteau / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master Stéphane Azoulay / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Pharmacology, cellular biology, drug efflux pumps, chemotherapy resistance, medicinal chemistry
Projet 6 : PepLink - Structural features and biological significance of a conserved sequence that links two domains in a protein from a plant receptor family Nadia Patino / Chimie / ICN CNRS / 1 Master Harald Keller / BioAgro / ISA INRA CNRS / 1 Master
Mots clés : Plant, malectin, receptor, unfolded protein response, peptide analysis, transient expression
Projet 8 : ModeLInvasion - Modéliser l’invasion tumorale Frédéric Luton / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master Olivier Pantz / Maths / LJAD UNS / 1 Master
Mots clés : Invasion tumorale, forces mécaniques cellulaires, modélisation computationnelle, modèles cellulaires en culture 3D
Projet 9 : NeurObMCHR2 - Synthèse d’antagonistes du récepteur MCHR2 et validation dans des modèles cellulaires et de souris « humanisées » Jean-Louis Nahon / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master Véronique MICHELET / Chimie / ICN CNRS / 1 Master Françoise Presse / Biologie/ IPMC
Mots clés : Comportement alimentaire, obésité, modèles de souris « humanisées », cerveau, neuropeptides, synthèse d’antagonistes du MCHR2, synthèse multi-étapes, méthodologies, synthèse asymétrique, catalyse
Projet 10 : CAVOBIOME - Rôle fonctionnel des poissons apogons dans les grottes méditerranéennes : étude du microbiome et écologie chimique Cécile Sabourault / BioMarine / ECOSEAS CNRS UNS / 1 Master Mohamed Mehiri / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Microbiome, poisson, chaine trophique, écologie chimique, antimicrobiens.
Projet 12 : MoBaMa - MOdélisation des interactions BActéries pathogènes-Macrophages Laurent Boyer / Biologie / C3M INSERM / 1 Master Fernando Peruani / Maths / LJAD UNS / 1 Master
Mots clés : Modélisation, Mathématique, infection, bactéries, immunité innée, inflammasome
Projet 13 : SuperDynamicFun - Super-resolution Imaging of Organelle Dynamics in a Human Fungal Pathogen Robert Arkowitz / Biologie / iBV CNRS UNS / 1 Master Laure Blanc-Feraud / Informatique / i3S CNRS INRIA / 1 Master Sébastien Schaub / Biologie / iBV CNRS UNS
Mots clés : Human fungal pathogen, super-resolution live cell microscopy, membrane compartment dynamics, temporal resolution
Projet 14 : HCAvis - Visualizing Human Cell Atlas Pascal Barbry / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master Marc Antonini / Informatique / INRIA / 1 Master
Mots clés : single cell, RNASeq, big data, data compression, image, biostatistics, deconvolution, airway epithelium diseases
Projet 15 : GENoise - Novel analysis framework to parse cell decision information from gene expression noise, applied to biomarker discovery of Cisplatin resistance in tumor cells Jérémie Roux / Biologie IRCAN CNRS / 1 Master Frederic Cazals / Informatique INRIA / 1 Master
Mots clés : single-cell, cancer, machine learning, protein-protein interaction network, RNAseq, phenomics, data sciences, drug resistance
Action 2
COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR
Installation en 2019 à l’IRCAN, NICE, d’une nouvelle équipe senior dirigée par
Miguel Godinho FERREIRA, DR2 CNRS
de Instituto Gulbenkian de Ciência, OEIRAS, PORTUGAL
Projet : TeloAge - Telomere shortening as a cause for age-related cancer incidence Objectifs: Role(s) of telomerase in cancer
Projet 1 : BioRegul - 4ème école jeunes chercheurs - Modélisation Formelle de Réseaux de Régulation Biologique.
École d’été en Modélisation pour la biologie des systèmes.
Lieu(x) et Date(s) : Porquerolles, du 23 au 28 juin 2019.
Porteur : COMET Jean-Paul / Informatique / i3S CNRS
Mots clés : Biologie des systèmes, réseaux génétiques, réseaux métaboliques, réseaux de signalisation, systèmes dynamiques, modélisation formelle, modèles prédictifs, cycle expérimentation-modélisation.
Cofinancement : Académies 1, 2 et 3.
Projet 2 : Entom19 - Le colloque des Entomophagistes, édition 2019.
Colloque avec conférencier invité.
Lieu(x) et Date(s) : Palais des Congrès de Juan les Pins, 27-29 mai 2019.
Porteur : Van OUDENHOVE Louise / BioAgro / ISA INRA
Mots clés : Colloque scientifique, insectes, parasitoïdes, prédateurs, biodiversité, lutte biologique.
Projet 3 : 30CCI - 30e colloque Canaux ioniques.
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : Sète, 8-11 septembre 2019.
Porteur : DIOCHOT Sylvie / Biologie / IPMC CNRS
Mots clés : Canaux ioniques, neurophysiologie, cardiologie, formation des étudiants en électrophysiologie, échange d’informations scientifiques (étudiants en thèse, postdoctorants, chercheurs).
Projet 4 : IPMC2019 - IPMC : 30 ans de biologie en Côte d’Azur.
Colloque scientifique.
Lieu(x) et Date(s) : Valbonne, 04 Septembre 2019.
Porteurs : CHAMI Mounia et SZMIDT Simon / Biologie / IPMC CNRS
Mots clés : Biologie, interdisciplinarité, recherche fondamentale, Université Côte d’Azur, IPMC.
Projet 5 : Nice-seq seminar series - Nice-seq: a genomic forum of the Nice bay area.
Seminar series.
Lieu(x) et Date(s) : Nice-Sophia Antipolis, June 2019 – December 2020.
Porteur : LITI Gianni / Biologie / IRCAN
Mots clés : genomics, bioinformatics, computational biology, quantitative biology, adaptive evolution.
Projet 6 : ICMA19 - Imaging in Cancer : multimodal analyzes.
One day symposium
Lieu(x) et Date(s) : Amphithéâtre grand château, Valrose, 27 Juin 2019
Porteur : HUEBER Anne-Odile / Biologie / iBV UNS.
Mots clés : Imaging, cancer, digital pathology, artificial intelligence, diagnostics.
Projet 7 : INC2020 - International Congress of Nematology.
International conference
Lieu(x) et Date(s) : Convention Center of Antibes, May 3-8th 2020.
Porteur : ABAD Pierre / BioAgro / ISA INRA
Mots clés : Nematology, Parasitology, Genomics, Physiology, Ecology, Biocontrol, Management.
Projet 8 : Aquavity - Aquatic research models to study regeneration and aging - Assessing aging in long-living, potentially immortal, aquatic animals.
Colloque
Lieu(x) et Date(s) : 1 Mai 2019 - Décembre 9 & 10, 2019
Porteur : ROTTINGER Eric / Biologie / IRCAN
Mots clés : Longévité, Régénération, Modèles aquatiques, Biologie comparative.
Sélection de DECEMBRE 2019
Projet 2 : SDS - Semaine du Son 2020.
Série de séminaires scientifiques et grand public sur 2 semaines
Lieu(x) et Date(s) : Nice, 20 janvier au 2 février 2020.
Porteur : Renaud DAVID / Médecine / CHU NICE
Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement, société.
Projet 3 : CJM2020 - Genetics, Environment, Signalling & Synaptic Plasticity in Developmental Brain Disorders : from Bench to Bedside.
Organisation d'une conférence Jacques MONOD
Lieu(x) et Date(s) : Roscoff, 11 au 15 Mai 2020 - Reporté pour cause d'épidémie de COVID19 en Mai 2021
Porteur : Barbara BARDONI / Biologie / IPMC
Mots clés : Neurodevelopment, signaling, genetics, genomics, therapy.
Projet 4 : DemosResolution - Démocratisons la Super-résolution! / Expand your super-resolution mind!
Atelier Recherche / Formation avec conférenciers invités
Lieu(x) et Date(s) : Nice, 26-27 Février 2020
Porteur : Frédéric BRAU / Biologie / IPMC
Mots clés : Super résolution, SRRF, STED, Expansion microscopy.
Cofinancement : Académie 2
Projet 5 : DynaProt - Dynamique des membranes et des protéines membranaires.
Aide au Montage d'un projet collaboratif de Formation par la Recherche ERASMUS+ /
Lieu(x) et Date(s) : Nice, Jan-Dec 2020
Porteur : Delphine BICHET / Biologie / IPMC
Mots clés : Formation/recherche, Master SVS, programme Erasmus+, dynamique des membranes, protéines membranaires, canaux ioniques
Action 4
THESE INTERDISCIPLINAIRE
Financement d'une thèse interdisciplinaire 2019-2020 préparé par Melody SUBRA
Projet : Architecture fonctionnelle et dynamique des sites de contact membranaire impliquant OSBP
Accueil : Drs Bruno MESMIN et Bruno ANTONNY (IPMC)
Action 5
Interdiscplinarité
MASTERCLASSES CATER_SVS2020
Projet : CATER_SVS2020 - Financement de 6 Masterclasses organisées par 6 étudiants en thèse en poste demi-ATER SVS 2019-2020
1- Cécilia COLSON (iBV) : Importance of nutritional fatty acids in thermogenic adipocyte metabolism
2- Christopher ROVERA (C3M) : Melanoma secreted factors educate lymph node fibroblasts
3- Camille SYSKA (ISA-INRAE) : Microbes in plant interactions
4- Joffrey MEJIAS (ISA-INRAE) : Root-knot nematode effectors facilitate giant cell formation
5- Alice ROUAN (IRCAN) : Ageing and telomeres in non-model organisms
6- Marine GAUTIER (IPMC) : Long non-coding RNAs in cancer aggressiveness
STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES
Projet 1 : EPI-ANALYSE - Développement d'outils de détection efficace des crises d'épilepsie chez la souris par analyse d'image et de signal EEG
Porteur 1 : F Duprat / Biologie / IPMC / 1 Master
Porteur 2 : T Papadopoulo / Informatique / INRIA / 1 Master
Mots clés : Epilepsie, modèles animaux, crise, analyse, image, vidéo, EEG, épileptogenèse, algorithme, interictal
Projet 2 : VIF-APAS - Vieillissement, Immuno-métabolisme et Fragilité : effets d'un Programme d’Activités Physiques Adaptées à des fins de Santé.
Porteur 1 : AS Rousseau / Biologie / C3M / 1 Master
Porteur 2 : R Zory / Sport / UNS LAMHESS / 1 Master
Mots clés : Immunité, Fragilité, Activités Physiques Adaptées, Vieillissement.
Projet 3 : NutriMorph - Lipides nutritionnels et remodelage cérébral: mesure de la plasticité gliale grâce à un outil de morphométrie cellulaire.
Porteur 1 : C Rovère / Biologie / IPMC / 1 Master
Porteur 2 : E Debreuve / Informatique / i3s INRIA/ 1 Master
Mots clés : Traitement de l'obésité, lipides nutritionnels, neuroinflammation, hypothalamus, astrocytes, microglie, plasticité cellulaire, analyse d'images, structures linéiques, extraction de caractéristiques, morphologie, topologie, classification non supervisée.
Projet 4 : CAID - Cibler conjointement et l’Angiogénèse et l’Inflammation dans la forme humide de la Dégénérescence maculaire liée à l’âge (DMLA).
Porteur 1 : S Martial / Chimie / ICN / 1 Master
Porteur 2 : L Demange / Biologie / IRCAN / 1 Master
Mots clés : Angiogenèse ; Inflammation ; DMLA; anticorps bispécifiques; chimie médicinale
Projet 5 : GIfTED - Synthetic small molecules inducing the differentiation of glioblastoma initiating cells: new perspectives in cancer chemotherapies.
Porteur 1 : M Duca / Chimie / ICN / 1 Master
Porteur 2 : T Virolle / Biologie / INSERM iBV / 1 Master
Mots clés : Chemistry, biology, cancer stem cells, tumor, miRNA, small molecular compounds, therapy
Projet 6 : ModHyMet - Modélisation hybride du métabolisme cellulaire.
Porteur 1 : JP Comet / Informatique / i3s UNS EPU / 1 Master
Porteur 2 : F Delaunay / Biologie / iBV / 1 Master
Mots clés : Métabolisme cellulaire, imagerie, cellule unique, modélisation hybride de réseaux métaboliques, méthodes formelles.
Action 2
COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR
Installation en 2018 à l’IBV, NICE, d’une nouvelle équipe ATIP/Avenir dirigée par
Projet 1 : 29CCI - 29ème colloque Canaux Ioniques
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 9-12 Septembre 2018, Le Lazaret, SETE, FRANCE.
Porteur : R Rapetti-Mauss / Biologie / iBV
Projet 2 : BAW@UCA - Semaine du Cerveau sur la Côte d'Azur
Série de conférences pour la culture scientifique.
Lieu(x) et Date(s) : 9-19 Mars 2018, 7-17 Mars 2019, NICE-SOPHIA ANTIPOLIS
Porteur : C Rovere et J Noël / Biologie / iPMC
LES PROFESSEURS INVITES 2018
Projet 3 : MycoPain - AT2R-TRAAK-Bioanalgesics
Invitation du Pr Felix Viana, tenure investigator, instituto de neurociencias, UMH-CSIC (SPAIN) pour une collaboration de recherches scientifiques.
Lieu(x) et Date(s) : 01/06/2018 - 31/07/2018.
Porteur : G Sandoz / Biologie / iBV Mots clés : Pain, Mycolactone, ion channels, CGPR.
Projet 4 : CattChannel - Invitation du Prof. W Catterall, Department of Pharmacology, University of Washington, SEATTLE, WA, USA.
Professeur invité, expert en "channelopaties".
Lieu(x) et Date(s) : 01/09/2018 - 15/ 12/2018.
Porteur : M Mantegazza / Biologie / IPMC.
Action 4
FINANCEMENTS D'INFRASTRUCTURES PARTAGEES
Après soumission à l’évaluation du conseil scientifique et à la validation du comité de pilotage, l’Académie 4 a financé en 2018 un projet collaboratif de 3 laboratoires avec un ingénieur dédié pendant 1 an et un budget de 110 k€.
Projet : MUTIMAGE_UCA - mise en place d’infrastructures et d’équipements fédérateurs (au fil de l’eau).
Porteur 1 : Frédéric BRAU, IRHC CNRS UMR 7275, IPMC
Porteur 2 : Faisal BEKKOUCHE, IE1 CNRS UMR 7009, Institut de la Mer de Villefranche
Porteur 3 : Robert ARKOWITZ, DR1 CNRS UMR 7277, IBV
Objectifs: fournir une base informatique fonctionnelle (OMERO) à tous les laboratoires des sciences de la vie azuréens pour faciliter la gestion, le partage et l’analyse des images biologiques pour promouvoir et stimuler l’analyse quantitative des données. La base a été mise en place en partenariat avec l'Institut Français de BioInformatique (ifb) et a été étendu à l'ensemble des stations marines membres de l'EMBRC France.
2017
Action 1
STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES
Projet 1 : FMRP-SUMO-ABS - Impacts atomiques et cellulaires des modifications par SUMO de la Fragile-X Mental Retardation Protein
Porteurs : C Gwizdek / Biologie / IPMC - F Cazals / Informatique / INRIA
Mots clés : Fragile-X mental retardation protein, SUMO, dynamique de complexes multiprotéiques, modélisation structurale
Projet 2 : MecanoAdipo - Modeling the mechanical feedback of adipogenesis
Porteurs : E Honore / Biologie / IPMC - B Mauroy / Maths / LJAD - JF Tanti / Biologie / C3M
Mots clés : Adipose tissue, adipogenesis, mechanical force, mechanotransduction, mathematical modeling
Projet 4 : IDEX_MITO - Détection, classification et caractérisation de réseaux mitochondriaux : application à la maladie d’Alzheimer et au cancer
Porteurs : X Descombes / Informatique / INRIA - M Chami / Biologie / IPMC - F Bost / Biologie / C3M
Mots clés : Mitochondrie, Alzheimer, Cancer, Imagerie, Modélisation, machine learning, perturbateur endocrinien
Projet 6: I2MD - Identification of inhibitors disrupting MITF interactions with DNA
Porteurs : A Burger / Chimie / ICN - C Bertolotto / Biologie / C3M
Mots clés : Biologie, Chimie, MITF, inhibition, fluorescence, polyamides
Projet 7 : REDAC - Recherche et caractérisation de drogues anti-invasion cancéreuse
Porteurs : M Franco / Biologie / IPMC - M Mehiri / Chimie / ICN
Mots clés : Drogues anti-cancéreuses, petite protéine G, invasion, Biochimie, synthèse chimique, criblage de molécules
Projet 8 : DEMOTECH - Développement de molécules pour la thérapie des hémopathies chimiorésistantes
Porteurs : A Martin / Chimie / ICN - G Robert / Biologie / C3M - T Cluzeau / Médecine / Hématologie clinique du CHU de Nice
Mots clés : Hémopathies, syndrômes myélodysplasiques, résistances, inhibiteurs, anticancéreux
Projet 9 : COMICS - Identification de composés immuno-stimulateurs antimicrobiens de nouvelle génération
Porteurs : T Michel / Chimie / ICN - L Boyer / Biologie / C3M
Mots clés : Parasite, Leishmaniose, substance naturelle, immunostimulation
Projet 8 : mTRANS - Role of distance and energy in vectorial lipid transport
Porteurs : G Drin / Biologie / IPMC - A Seminara / Physique / INPHYNI
Mots clés : Transfert proteins, lipid gradient, in vitro assays, distance, microfluidics
Projet 9 : mMpH - Fast measurements of intracellular pH using microfuidic systems
Porteurs : L Counillon / Biologie / LP2M - X Noblin / Physique / INPHYNI
Mots clés : pH dynamics, microfluidics, modelisation
Projet 10 : NMLA-scRNASEQ - New machine learning approaches for single cell RNA seq analysis
Porteurs : A Paquet / Biologie / IPMC - M Barlaud / Informatique / I3S
Mots clés : Single cell, RNASeq, big data, machine learning, gene network, biostatistics, deconvolution, airway epithelium diseases
Action 2
COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION DE NOUVELLES EQUIPES DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR
Deux jeunes équipes ATIP/Avenir se sont installées à l'Institut de Biologie de Valrose (iBV) depuis Juin 2016.
Ces deux équipes sont co-financées par l'Académie 4 pour leur première année d'installation.
1- Equipe ATIP/Avenir installée à l'iBV dirigée par
Projet 1 : ONCOAGE_MD ANDERSON - 2nd symposium ONCOAGE-MD ANDERSON: 1st joint meeting on lung cancer
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 6 au 7 Septembre 2018, au Centre universitaire méditerranéen, NICE
Porteur : P Hofman (CHU Nice)
Site web : https://www.oncoage.org/06-07-september-2018-joint-meeting-on-lung-cancer/
Projet 2 : CFC-2017 - 10ème meeting cils, flagelles et centrosomes, 2017
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 10 au 12 octobre 2017, hôtel Saint Paul (NICE)
Porteur : L E Zaragosi-Rathelot (IPMC)
Site web : http://univ-cotedazur.fr/events/cfc2017
Projet 3 : NICE RNA 2018 - The multiple facets of RNA in health and disease
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 7 au 9 février 2018, Grand château Valrose
Porteur : B Mari (IPMC)
Site web : http://univ-cotedazur.fr/events/rna2018/
Projet 5 : CareerEXPO2018 - CareerEXPO2018 is an annual exchange and networking event for PhD candidates and young researchers along with industry professionals.
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 9 mars 2018, campus Saint Jean d'Angely, NICE
Porteur : association IGBio de l'Ecole Doctorale SVS85 (LPMM, IRCAN, IPMC, LABEX SignaLife, ICST, DISTALZ, UNS) Comité d'organisation étudiant : Auréa COPHIGNON / LP2M - Tomás DE GARAY / IRCAN - Sanya Eduarda KUZET / IRCAN - Racha Fayad / IPMC
Site web : https://www.igbio-uca.com/careerexpo
Projet 6 : APHA- Accueil Pr Heinz Arnheiter, MD, scientifique émérite
Professeur invité avec conférences dispensées.
Lieu(x) et Date(s) : Sept-Oct 2018, C3M
Porteur : C Bertolotto (C3M)
Mots clés : Biologie, découverte, MITF, éditeur en chef
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