Projets financés

Projets de l'Académie 4
Projets de l'Académie 4

2021
Action 1


STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

En Avril 2021, 6 projets de recherche ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 4 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2021, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 5 projets à financer en 2021 ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 2021_1
Kill_HIF - A novel antagonist of HIF-1alpha to target cancer.
Nathalie MAZURE, mazure@unice.fr, DR2 CNRS / Biologie / INSERM U1065, C3M / 1 Master.
Mohamed MEHIRI, Mohamed.mehiri@univ-cotedazur.fr, MCU HDR / Chimie / ICN / 1 Master.
Frédéric BOST.
Mots clés : Cancer, Inhibiteur, HIF-1, Hypoxie, Substances naturelles marines.

Projet 2021_2
RNP_IMAGE - Developing methodologies to quantitatively analyze RNP granule dynamic properties upon aging.
Florence BESSE, Florence.besse@univ-cotedazur.fr / Biologie / iBV / 1 Master.
Xavier DESCOMBES, xavier.descombes@inria.fr / Informatique / INRIA / 1 Master.
Fabienne DE GRAEVE & Eric DEBREUVE.
Mots clés : biological condensates, RNP granules, high-resolution live imaging, automatic object detection, quantitative image analysis.

Projet 2021_4
Chemi_RNP - Optimisation de composés chimiques ciblant les granules à ARN.
Patrick BREST, patrick.brest@univ-cotedazur.fr / CRCN INSERM / Biologie / IRCAN / 1 Master.
Maria DUCA, maria.duca@univ-cotedazur.fr / CRCN CNRS / Chimie / ICN / 1 Master.
NICOLINI Victoria, JACQUET Karine & Di Giorgio Audrey.
Mots clés : Granules à ARN, Processing bodies, ribonucléoproteine, criblage chimique.

Projet 2021_5
PROoF - Comment protéger les forêts marines Méditerranéennes des poissons herbivores ? (PROtection of marine forests from herbivorous Fishes).
Luisa PASSERON-MANGIALAJO, Luisa.PASSERON-MANGIALAJO@univ-cotedazur.fr / MCF HC HDR / Ecologie fonctionnelle / ECOSEAS / 1 Master.
Nathalie LAZARIC, Nathalie.LAZARIC@univcotedazur.fr / DR CNRS / Economie / GREDEG / 1 Master.
Cécile SABOURAULT & Mohamed MEHIRI.
Mots clés : forêts marines, poissons herbivores, écologie chimique, changements de comportements des consommateurs, valorisation économique, gouvernance des écosystèmes, biens communs.

Projet 2021_6
AmpFluo3D - Solution innovante d’AMPlification de la FLUOrescence appliquée à la détection de marqueurs sur cultures cellulaires tridimensionnelles.
Frédéric BRAU, brau@ipmc.cnrs.fr / IR HC CNRS / Biologie / IPMC / 1 Master.
Tatiana BUDTOVA, tatiana.budtova@mines-paristech.fr DR / Physiques / Mines ParisTech / 1 Master.
LIPPI Gian Luca & LUTON Frédéric.
Mots clés : Imagerie cellulaire, Culture 3D, Bio-aérogels, Polysaccharides, diffusion de la lumière, Fluorescence.
 

Action 2


COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en Janvier 2021 au Laboratoire de Physio Médecine Moléculaire (LP2M), UMR7370 CNRS, Université Côte d’Azur, NICE, de la nouvelle équipe ATIP Avenir : TNT - Recherche Translationelle en Néphrologie et Transplantation.

L'équipe est dirigée par :

Antoine SICARD, MD, PhD

Co-responsable Équipe de recherche clinique INNOVANT Immunomonitoring et thérapies Innovantes en Auto-immunité, Néphrologie et Transplantation, Unité de Recherche Clinique Côte d’Azur (UR2CA) Université Côte d’Azur
Praticien Hospitalier Universitaire du Service de néphrologie-dialyse-transplantation, Hôpital Pasteur II, CHU de Nice

En provenance de : 
Equipe du Pr Levings, Surgery department, BCCHRI, University of British Columbia, Vancouver, Canada
Equipe du Pr Glaichenhaus, IPMC, UMR 7275, CNRS, Sophia Antipolis


Project : IPRAM - Innovative immunotherapeutic procedures for preventing antibody-mediated rejection in transplant candidates 
Objectives: to reduce the risk of rejection and infection in HLA-sensitized transplant patients by selectively targeting anti-HLA antibody-producing B cells.

Anti-HLA antibodies & Graft destruction
Anti-HLA antibodies & Graft destruction


Key words : kidney transplantation, antibody-mediated rejection, desensitization, immunotherapy, cell therapy, chimeric antigen receptor T cells
Website: http://unice.fr/lp2m/fr
 

Action 3


ANIMATION SCIENTIFIQUE

En Avril 2020, 5 projets de conférence ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2020, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 3 projets de séminaires ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.
Ces séminaires ont été reportées en 2021 pour des raisons de crise sanitaire due au CoViD-19.

Projet 3_2 : 31CCI - 31è Colloque Canaux Ioniques
Porteur : Sylvie DIOCHOT / Biologie / IPMC CNRS UMR7275
Lieu et dates : Sète, reporté en 2022
Mot clés : canaux ioniques, neurophysiologie, cardiologie, électrophysiologie, échange d’informations scientifiques (étudiants doctorants, post-doctorants, chercheurs)

Projet 3_3 : JMLC - 3rd Joint Meeting on Lung Cancer
Porteur : Paul HOFMAN / Santé / IRCAN INSERM CHU Hôpital Pasteur 1
Lieu et dates : Nice, reporté en 2022
Mots clés : Cancer du poumon, Biomarqueurs, OncoAge, MD Anderson

Projet 3_5 : SDS_2021 - Semaine du Son de l’Unesco NICE 2021
Porteur : Renaud DAVID / Santé / CMRR CHU Université Côte d’Azur
Lieux et dates : Pasteur 2 Amphithéâtre GALET, NICE et en visioconférence, 5 au 12 juin 2021
Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement
Photos et Vidéos ici : Semaine du Son de l’Unesco NICE 2021

2020
Action 1


STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

En Avril 2020, 11 projets de recherche ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 4 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2020, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 9 projets à financer en 2020 ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 1_1 : ADOLYS - Adressage d’oncogènes au lysosome grâce à des molécules chimères de synthèse
Guillaume ROBERT / Biologie / C3M / 1 M2
Anthony MARTIN / Chimie / ICN / 1 M2
Mots clés : CMA, Molécule chimère, Lysosome, Oncogène, Hémopathies Myéloïdes, Ligation-Chimique, Bio-Conjugaison

Projet 1_3 : DARKtoLiGHT - Development of DRET-based fluorogenic probes for imaging of RNA subcellular distribution
Florence BESSE / Biologie / iBV / 1 M2
Benoît MICHEL / Chimie / ICN / 1 M2
Partenaires : Fabienne DE GRAEVE, Alain BURGER
Mots clés : Subcellular RNA localization, Compartmentalization, RNP granules, S/N ratio, fluorogenic probes, push–pull fluorophores, RNA detection, 2-photon imaging

Projet 1_4 : Hyp-ATACK - Hypusination targeting of cancer
Frédéric BOST / Biologie / C3M / M2
Mohamed MEHIRI / Chimie / ICN / M2
Partenaires : Victor TIROILLE, Kathiane LAURENT
Mots clés : Cancer, Hypusination, Substances naturelles marines, Composés de synthèse, Polyamines, Métabolomique

Projet 1_5 : TREAT-X – Identification of new therapeutics to treat Fragile X Syndrome and autism
Maria CAPOVILLA / Biologie / IPMC / M2
Maria DUCA / Chimie / ICN / M2
Partenaires : Barbara BARDONI, Marielle JARJAT, Audrey Di GIORGIO.
Mots clés : Fragile X Syndrome, therapy, RNA-binding, mass-spectrometry, blood-brain-barrier

Projet 1_6 : PRO-ZOOM – Impact of the PROton flux emitted by roots in the rhizosphere on ZOOspores Motion
Agnès ATTARD / Biologie / ISA INRAE / M2
Philippe THOMEN / Physique / INPHYNI / M2
Partenaires : Eric GALIANA; Joelle Le BERRE; Naïma MINET; Catherine MURA; Céline COHEN; Xavier NOBLIN
Mots clés : Microfluidic device, plant pathology, proton pumps, Arabidospis, zoospore motion, attraction, ionic gradient.

Projet 1_8 : MASCOT - Machine-learning et analyse des mouvements collectifs chez les trichogrammes
Louise VAN OUDENHOVE / Biologie / ISA INRAE / M2
François BREMONT / Informatique / INRIA / M2
Partenaires : Vincent CALCAGNO; Guy PEREZ; Monique THONNAT
Mots clés : Trichogramma; interactions sociales; mouvement collectif; intelligence artificielle; analyse d’images; algorithmes d’apprentissage

Projet 1_9 : SYNCHRO - Modélisation mathématique et outils expérimentaux pour l’étude du couplage intercellulaire entre oscillateurs circadiens de cellules périphériques
Madalena CHAVES / Informatique / INRIA / M2
Michèle TEBOUL / Biologie / iBV / M2
Partenaires : Firippi Eleni; Nicolas Augier; Delaunay Franck; Guérin Sophie; Monterosso Baptiste
Mots clés : Modèles linéaires par morceaux, couplage, synchronisation, oscillateur circadien

Projet 1_10 : SeizPred - Novel AI approach for seizure prediction in mouse models
Massimo MANTEGAZZA / Biologie / IPMC / M2
Marco LORENZI / Informatique / INRIA / M2
Partenaires : Fabrice DUPRAT, Fabrizio CAPITANO, Etrit HAXHOLLI, Carlo FANARA
Mots clés : Artificial intelligence algorithms, seizure prediction, epileptic encephalopathies, closed loop stimulation, risk modeling, time series analysis, therapeutic strategies

Projet 1_11 : LeftRightReliable - Reliable signalling in heterogeneous biological objects: The case of the zebrafish Left-Right Organizer
Maximilian FÜRTHAUER / Biologie / IBV / M2
Xavier DESCOMBES / Informatique / i3S INRIA / M2
Partenaires : Sophie POLES, Renaud REBILLARD
Mots clés : Left-Right asymmetry, Cell Signalling, Biological noise, Zebrafish
 

Action 2


COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en Août 2020 à l’IPMC, SOPHIA ANTIPOLIS, d’une nouvelle équipe ATIP dirigée par 

Takeshi HARAYAMA, PhD, de l’UNIGE (SUISSE)

Projet : FACiL - Functions of Acyl-Chains in Lipid Membranes 

Objectifs
Search for the function of glycerophospholipids (GPLs) Acyl Chains at the molecular level in mammalian cells through two major projects :
Project 1: Molecular mechanisms linking linoleic acid-rich GPLs to adipogenesis.
Project 2: Relationship between acyl-chain asymmetry and phase separation.  

GPL Acyl chains
GPL Acyl chains


Mots clés : Membrane, Lipid, Adipocyte, Differentiation, Mesenchymal stem cells, CRISPR/Cas9, Phase separation, Lipid raft
Site WebMétabolisme et fonctions des lipides membranaires

Action 3


ANIMATION SCIENTIFIQUE DE L'ACADEMIE 4

En Avril 2020, 5 projets de conférence ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2020, le comité de pilotage a validé la sélection finale de 3 projets de séminaires, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.
Ces séminaires ont été reportées en 2021 pour des raisons de crise sanitaire due au CoViD-19.
 

2019
Action 1


STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

En Avril 2019, 15 projets de recherche ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2019, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 12 projets ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 1 : MOORPHEUS - Modélisation computationnelle de la croissance et de l’organisation spatiale dynamique des organoïdes / tumoroïdes de prostate
Stephan Clavel / Biologie / C3M INSERM / 1 Master
Xavier Descombes / Informatique / INRIA / 1 Master
Frédéric Bost/ Biologie / C3M
Mots clés : Modélisation computationnelle, organoïdes, analyse d’image, simulation numérique, prostate,cancer, culture cellulaire  3D

Projet 2 : Sensaas - Sensitive surface as a shape : Calcul de la similarité moléculaire par comparaison de formes 3D à des fins de criblage virtuel
Dominique Douguet / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master
Frédéric Payan / Informatique / i3S UNS / 1 Master
Marc Antonini / Informatique / i3S UNS
Mots clés : Enveloppe moléculaire ; Similarité ; Criblage virtuel ; Recalage de nuages de points ; Apprentissage profond

Projet 4 : MCSPegylation - Entropic barriers to control protein movements at membrane contact sites
Bruno Antonny / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master
Alain Burger / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Instrinsically unstructured region, Membrane contact site, Click chemistry, Protein PEGylation

Projet 5 : PatchedChemoBio - Inhibition of Ptch1 chemotherapy resistance activity : cellular and chemical approaches
Isabelle Mus-Veteau / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master
Stéphane Azoulay / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Pharmacology, cellular biology, drug efflux pumps, chemotherapy resistance, medicinal chemistry

Projet 6 : PepLink - Structural features and biological significance of a conserved sequence that links two domains in a protein from a plant receptor family
Nadia Patino / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Harald Keller / BioAgro / ISA INRA CNRS / 1 Master
Mots clés : Plant, malectin, receptor, unfolded protein response, peptide analysis, transient expression

Projet 8 : ModeLInvasion - Modéliser l’invasion tumorale
Frédéric Luton / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master
Olivier Pantz / Maths / LJAD UNS / 1 Master
Mots clés : Invasion tumorale, forces mécaniques cellulaires, modélisation computationnelle, modèles cellulaires en culture 3D

Projet 9 : NeurObMCHR2 - Synthèse d’antagonistes du récepteur MCHR2 et validation dans des modèles cellulaires et de souris « humanisées »
Jean-Louis Nahon / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master
Véronique MICHELET / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Françoise Presse / Biologie/ IPMC
Mots clés : Comportement alimentaire, obésité, modèles de souris « humanisées », cerveau, neuropeptides, synthèse d’antagonistes du MCHR2, synthèse multi-étapes, méthodologies, synthèse asymétrique, catalyse

Projet 10 : CAVOBIOME - Rôle fonctionnel des poissons apogons dans les grottes méditerranéennes : étude du microbiome et écologie chimique
Cécile Sabourault / BioMarine / ECOSEAS CNRS UNS / 1 Master
Mohamed Mehiri / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Microbiome, poisson, chaine trophique, écologie chimique, antimicrobiens.

Projet 12 : MoBaMa - MOdélisation des interactions BActéries pathogènes-Macrophages
Laurent Boyer / Biologie / C3M INSERM / 1 Master
Fernando Peruani / Maths / LJAD UNS / 1 Master
Mots clés : Modélisation, Mathématique, infection, bactéries, immunité innée, inflammasome

Projet 13 : SuperDynamicFun - Super-resolution Imaging of Organelle Dynamics in a Human Fungal Pathogen
Robert Arkowitz / Biologie / iBV CNRS UNS / 1 Master
Laure Blanc-Feraud / Informatique / i3S CNRS INRIA / 1 Master
Sébastien Schaub / Biologie / iBV CNRS UNS
Mots clés : Human fungal pathogen, super-resolution live cell microscopy, membrane compartment dynamics, temporal resolution

Projet 14 : HCAvis - Visualizing Human Cell Atlas
Pascal Barbry / Biologie / IPMC CNRS / 1 Master
Marc Antonini / Informatique / INRIA / 1 Master
Mots clés : single cell, RNASeq, big data, data compression, image, biostatistics, deconvolution, airway epithelium diseases

Projet 15 : GENoise - Novel analysis framework to parse cell decision information from gene expression noise, applied to biomarker discovery of Cisplatin resistance in tumor cells
Jérémie Roux / Biologie IRCAN CNRS / 1 Master
Frederic Cazals / Informatique INRIA / 1 Master
Mots clés : single-cell, cancer, machine learning, protein-protein interaction network, RNAseq, phenomics, data sciences, drug resistance
 

Action 2


COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en 2019 à l’IRCAN, NICE, d’une nouvelle équipe senior dirigée par

Miguel Godinho FERREIRA, DR2 CNRS

de Instituto Gulbenkian de Ciência, OEIRAS, PORTUGAL
Projet : TeloAge - Telomere shortening as a cause for age-related cancer incidence 
Objectifs: Role(s) of telomerase in cancer

Telomeres Cancer
Telomeres Cancer


Mots clés : Aging; Cancer, Melanoma; Telomerase; Telomeres; Zebrafish
Site Webhttps://www.ircan.org/en/research/miguel-godinho-ferreira

Action 3

ANIMATION SCIENTIFIQUE DE L'ACADEMIE 4

Après évaluation par les membres du conseil scientifique, l'Académie a financé
- en Juin 2019 : 8 projets de conférence avec des chercheurs invités,
- en Décembre 2019 : 2 projets de conférence, 1 projet d'Atelier / Formation et 1 projet d'aide au Montage de Projet Collaboratif pour la mise en place d'une formation ERASMUS+.


Sélection de JUIN 2019

Projet 1 : BioRegul - 4ème école jeunes chercheurs - Modélisation Formelle de Réseaux de Régulation Biologique.
École d’été en Modélisation pour la biologie des systèmes.
Lieu(x) et Date(s) : Porquerolles, du 23 au 28 juin 2019.
Porteur : COMET Jean-Paul / Informatique / i3S CNRS
Mots clés : Biologie des systèmes, réseaux génétiques, réseaux métaboliques, réseaux de signalisation, systèmes dynamiques, modélisation formelle, modèles prédictifs, cycle expérimentation-modélisation.
Cofinancement : Académies 1, 2 et 3.

Projet 2 : Entom19 - Le colloque des Entomophagistes, édition 2019.
Colloque avec conférencier invité.
Lieu(x) et Date(s) : Palais des Congrès de Juan les Pins, 27-29 mai 2019.
Porteur : Van OUDENHOVE Louise / BioAgro / ISA INRA
Mots clés : Colloque scientifique, insectes, parasitoïdes, prédateurs, biodiversité, lutte biologique.

Projet 3 : 30CCI - 30e colloque Canaux ioniques.
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : Sète, 8-11 septembre 2019.
Porteur : DIOCHOT Sylvie / Biologie / IPMC CNRS
Mots clés : Canaux ioniques, neurophysiologie, cardiologie, formation des étudiants en électrophysiologie, échange d’informations scientifiques (étudiants en thèse, postdoctorants, chercheurs).

Projet 4 : IPMC2019 - IPMC : 30 ans de biologie en Côte d’Azur.
Colloque scientifique.
Lieu(x) et Date(s) : Valbonne, 04 Septembre 2019.
Porteurs : CHAMI Mounia et SZMIDT Simon / Biologie / IPMC CNRS
Mots clés : Biologie, interdisciplinarité, recherche fondamentale, Université Côte d’Azur, IPMC.

Projet 5 : Nice-seq seminar series - Nice-seq: a genomic forum of the Nice bay area.
Seminar series.
Lieu(x) et Date(s) : Nice-Sophia Antipolis, June 2019 – December 2020.
Porteur : LITI Gianni / Biologie / IRCAN
Mots clés : genomics, bioinformatics, computational biology, quantitative biology, adaptive evolution.

Projet 6 : ICMA19 - Imaging in Cancer : multimodal analyzes.
One day symposium
Lieu(x) et Date(s) : Amphithéâtre grand château, Valrose, 27 Juin 2019
Porteur : HUEBER Anne-Odile / Biologie / iBV UNS.
Mots clés : Imaging, cancer, digital pathology, artificial intelligence, diagnostics.

Projet 7 : INC2020 - International Congress of Nematology.
International conference
Lieu(x) et Date(s) : Convention Center of Antibes, May 3-8th 2020.
Porteur : ABAD Pierre / BioAgro / ISA INRA
Mots clés : Nematology, Parasitology, Genomics, Physiology, Ecology, Biocontrol, Management.

Projet 8 : Aquavity - Aquatic research models to study regeneration and aging - Assessing aging in long-living, potentially immortal, aquatic animals.
Colloque
Lieu(x) et Date(s) : 1 Mai 2019 - Décembre 9 & 10, 2019
Porteur : ROTTINGER Eric / Biologie / IRCAN
Mots clés : Longévité, Régénération, Modèles aquatiques, Biologie comparative.


Sélection de DECEMBRE 2019

Projet 2 : SDS - Semaine du Son 2020.
Série de séminaires scientifiques et grand public sur 2 semaines
Lieu(x) et Date(s) : Nice, 20 janvier au 2 février 2020.
Porteur : Renaud DAVID / Médecine / CHU NICE
Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement, société.

Projet 3 : CJM2020 - Genetics, Environment, Signalling & Synaptic Plasticity in Developmental Brain Disorders : from Bench to Bedside.
Organisation d'une conférence Jacques MONOD
Lieu(x) et Date(s) : Roscoff, 11 au 15 Mai 2020 - Reporté pour cause d'épidémie de COVID19 en Mai 2021
Porteur : Barbara BARDONI / Biologie / IPMC
Mots clés : Neurodevelopment, signaling, genetics, genomics, therapy.

Projet 4 : DemosResolution - Démocratisons la Super-résolution! / Expand your super-resolution mind!
Atelier Recherche / Formation avec conférenciers invités
Lieu(x) et Date(s) : Nice, 26-27 Février 2020
Porteur : Frédéric BRAU / Biologie / IPMC
Mots clés : Super résolution, SRRF, STED, Expansion microscopy.
Cofinancement : Académie 2

Projet 5 : DynaProt - Dynamique des membranes et des protéines membranaires.
Aide au Montage d'un projet collaboratif de Formation par la Recherche ERASMUS+ /
Lieu(x) et Date(s) : Nice, Jan-Dec 2020
Porteur : Delphine BICHET / Biologie / IPMC
Mots clés : Formation/recherche, Master SVS, programme Erasmus+, dynamique des membranes, protéines membranaires, canaux ioniques
 

Action 4


THESE INTERDISCIPLINAIRE

Financement d'une thèse interdisciplinaire 2019-2020 préparé par Melody SUBRA
Projet : Architecture fonctionnelle et dynamique des sites de contact membranaire impliquant OSBP
Accueil : Drs Bruno MESMIN et Bruno ANTONNY (IPMC)
 

Action 5

Interdiscplinarité
Interdiscplinarité


MASTERCLASSES CATER_SVS2020

Projet : CATER_SVS2020 - Financement de 6 Masterclasses organisées par 6 étudiants en thèse en poste demi-ATER SVS 2019-2020

1- Cécilia COLSON (iBV) : Importance of nutritional fatty acids in thermogenic adipocyte metabolism
2- Christopher ROVERA (C3M) :  Melanoma secreted factors educate lymph node fibroblasts
3- Camille SYSKA (ISA-INRAE) : Microbes in plant interactions
4- Joffrey MEJIAS (ISA-INRAE) : Root-knot nematode effectors facilitate giant cell formation
5- Alice ROUAN (IRCAN) : Ageing and telomeres in non-model organisms
6- Marine GAUTIER (IPMC) : Long non-coding RNAs in cancer aggressiveness

Mots clés : Demi contrat ATER, Biologie, masterclasses, Intéressement, formation, recherche, transdisciplinarité

2018
Action 1


STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

8 projets de recherche ont été reçus et évalués chacun par 4 ou 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2018, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 6 projets ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 1 : EPI-ANALYSE - Développement d'outils de détection efficace des crises d'épilepsie chez la souris par analyse d'image et de signal EEG
Porteur 1 : F Duprat / Biologie / IPMC / 1 Master
Porteur 2 : T Papadopoulo / Informatique / INRIA / 1 Master
Mots clés : Epilepsie, modèles animaux, crise, analyse, image, vidéo, EEG, épileptogenèse, algorithme, interictal

Projet 2 : VIF-APAS - Vieillissement, Immuno-métabolisme et Fragilité : effets d'un Programme d’Activités Physiques Adaptées à des fins de Santé.
Porteur 1 : AS Rousseau / Biologie / C3M / 1 Master
Porteur 2 : R Zory / Sport / UNS LAMHESS / 1 Master
Mots clés : Immunité, Fragilité, Activités Physiques Adaptées, Vieillissement.

Projet 3 : NutriMorph - Lipides nutritionnels et remodelage cérébral: mesure de la plasticité gliale grâce à un outil de morphométrie cellulaire.
Porteur 1 : C Rovère / Biologie / IPMC / 1 Master
Porteur 2 : E Debreuve / Informatique / i3s INRIA/ 1 Master
Mots clés : Traitement de l'obésité, lipides nutritionnels, neuroinflammation, hypothalamus, astrocytes, microglie, plasticité cellulaire, analyse d'images, structures linéiques, extraction de caractéristiques, morphologie, topologie, classification non supervisée.

Projet 4 : CAID - Cibler conjointement et l’Angiogénèse et l’Inflammation dans la forme humide de la Dégénérescence maculaire liée à l’âge (DMLA).
Porteur 1 : S Martial / Chimie / ICN / 1 Master
Porteur 2 : L Demange / Biologie / IRCAN / 1 Master
Mots clés : Angiogenèse ; Inflammation ; DMLA; anticorps bispécifiques; chimie médicinale

Projet 5 : GIfTED - Synthetic small molecules inducing the differentiation of glioblastoma initiating cells: new perspectives in cancer chemotherapies.
Porteur 1 : M Duca / Chimie / ICN / 1 Master
Porteur 2 : T Virolle / Biologie / INSERM iBV / 1 Master
Mots clés : Chemistry, biology, cancer stem cells, tumor, miRNA, small molecular compounds, therapy

Projet 6 : ModHyMet - Modélisation hybride du métabolisme cellulaire.
Porteur 1 : JP Comet / Informatique / i3s UNS EPU / 1 Master
Porteur 2 : F Delaunay / Biologie / iBV / 1 Master
Mots clés : Métabolisme cellulaire, imagerie, cellule unique, modélisation hybride de réseaux métaboliques, méthodes formelles.
 

Action 2


COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en 2018 à l’IBV, NICE, d’une nouvelle équipe ATIP/Avenir  dirigée par 

Bruno HUDRY (CR CNRS) 

de MRC Clinical Sciences Centre, LONDON, UK.

Projet : CellSex - Importance of the cellular sex and underlying mechanisms.
Objectives: Comprendre comment la présence intrinsèque cellulaire des chromosomes sexuels, le sexe cellulaire, influence les autres tissus somatiques / To understand how the cell intrinsic presence of sex chromosomes, cellular sex, impacts on other somatic tissues.
Mots clés: Cell differentiation, physiology and dynamics, Development, developmental genetics, pattern formation and embryology in animals, RNA synthesis, processing, modification and degradation, Transcriptomics, Fly.
Site Webhttp://ibv.unice.fr/research-team/hudry/

Importance of the cellular sex and underlying mechanisms.
Importance of the cellular sex and underlying mechanisms.

Bruno HUDRY a obtenu un financement ERC Starting Grant pour ce projet en 2019. Plus d'informations : https://erc.europa.eu/projects-figures/erc-funded-projects/results?items_per_page=20&f%5B0%5D=funding_scheme%3AStarting%20Grant%20%28StG%29&page=31
 

Action 3


ANIMATION SCIENTIFIQUE DE L'ACADEMIE 4

En Juin 2018, 2 projets de conférence et 2 projets de venue de professeur invité ont été financés par l’Académie 4 après évaluation par des membres du conseil scientifique de l'Académie.


LES CONFERENCES 2018

Projet 1 : 29CCI - 29ème colloque Canaux Ioniques
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) :  9-12 Septembre 2018, Le Lazaret, SETE, FRANCE.
Porteur : R Rapetti-Mauss / Biologie / iBV
Mots clés : Canaux ioniques, formation des étudiants, plateforme d'interaction scientifique.
Objectifs : L’association des canaux ioniques a été créée il y a 28 ans pour permettre à la communauté scientifique travaillant sur les canaux ioniques de partager leurs connaissances et expériences à l’occasion d’un colloque annuel organisé par l’association. Chaque année un président et un comité d’organisation sont élus par les membres de l’association. Les objectifs de ce colloque sont (1) de faire le point sur les dernières avancées dans l’étude des canaux ioniques ; (2) de promouvoir les échanges entre les participants, (unité de lieu pour les conférences et pour l’hébergement et la restauration). En particulier nous nous attachons à promouvoir les rencontres entre étudiants et scientifiques établis, mais nous favorisons également la mise en place de collaborations, ce qui constitue une véritable plateforme d’échange pour les chercheurs issus de l’Université Côte d'Azur avec la communauté des canaux ioniques.

Projet 2 : BAW@UCA - Semaine du Cerveau sur la Côte d'Azur
Série de conférences pour la culture scientifique.
Lieu(x) et Date(s) : 9-19 Mars 2018, 7-17 Mars 2019, NICE-SOPHIA ANTIPOLIS
Porteur : C Rovere et J Noël / Biologie / iPMC
Mots clés : Cerveau, culture scientifique, partenaire UCA, interdisciplinarité.
Objectifs : La « Semaine du Cerveau sur la Côte d’Azur 2019 », BAW@UCA_2019, s’inspire de l’expérience accumulée au cours des 10 éditions précédentes et s’inscrit dans la dynamique ascendante créée ces dernières années pour aborder le thème du «Cerveau créatif et artistique».


LES PROFESSEURS INVITES 2018

Projet 3 : MycoPain - AT2R-TRAAK-Bioanalgesics
Invitation du Pr Felix Viana, tenure investigator, instituto de neurociencias, UMH-CSIC (SPAIN) pour une collaboration de recherches scientifiques.
Lieu(x) et Date(s) : 01/06/2018 - 31/07/2018.
Porteur : G Sandoz / Biologie / iBV
Mots clés : Pain, Mycolactone, ion channels, CGPR.
Objectifs : Etudier en détail la voie de signalisation entre AT2R et TRAAK. 

Projet 4 : CattChannel - Invitation du Prof. W Catterall, Department of Pharmacology, University of Washington, SEATTLE, WA, USA.
Professeur invité, expert en "channelopaties".
Lieu(x) et Date(s) : 01/09/2018 - 15/ 12/2018.
Porteur : M Mantegazza / Biologie / IPMC.
Mots clés : Ion channels, excitability, synaptic plasticity, channelopathies, neurobiologies
Objectifs : Prof Catterall spent 3,5 months at UCA and was hosted by the IPMC. He interacted with local scientists developing high impact collaborative projects and provided top level lectures for master students, PHD students and researchers. He contributed to organize a symposium on neuronal channelopathies and pathologies of neuronal excitability with local and international speakers.
 

Action 4


FINANCEMENTS D'INFRASTRUCTURES PARTAGEES

Après soumission à l’évaluation du conseil scientifique et à la validation du comité de pilotage, l’Académie 4 a financé en 2018 un projet collaboratif de 3 laboratoires avec un ingénieur dédié pendant 1 an et un budget de 110 k€.

Projet : MUTIMAGE_UCA - mise en place d’infrastructures et d’équipements fédérateurs (au fil de l’eau).
Porteur 1 : Frédéric BRAU, IRHC CNRS UMR 7275, IPMC
Porteur 2 : Faisal BEKKOUCHE, IE1 CNRS UMR 7009, Institut de la Mer de Villefranche
Porteur 3 : Robert ARKOWITZ, DR1 CNRS UMR 7277, IBV

Objectifs: fournir une base informatique fonctionnelle (OMERO) à tous les laboratoires des sciences de la vie azuréens pour faciliter la gestion, le partage et l’analyse des images biologiques pour promouvoir et stimuler l’analyse quantitative des données. La base a été mise en place en partenariat avec l'Institut Français de BioInformatique (ifb) et a été étendu à l'ensemble des stations marines membres de l'EMBRC France.

Périmètre de la base de données en 2020 :

Périmètre en 2020 de la base de données mise en place par la plateforme MUTIMAGE_UCA
Périmètre en 2020 de la base de données mise en place par la plateforme MUTIMAGE_UCA

 

2017
Action 1


STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

12 projets de recherche ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par 4 ou 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
Le comité de pilotage a validé la sélection finale des 10 projets ci-dessous en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 1 : FMRP-SUMO-ABS - Impacts atomiques et cellulaires des modifications par SUMO de la Fragile-X Mental Retardation Protein
Porteurs : C Gwizdek / Biologie / IPMC - F Cazals / Informatique / INRIA 
Mots clés : Fragile-X mental retardation protein, SUMO, dynamique de complexes multiprotéiques, modélisation structurale

Projet 2 : MecanoAdipo - Modeling the mechanical feedback of adipogenesis
Porteurs : E Honore / Biologie / IPMC - B Mauroy / Maths / LJAD - JF Tanti / Biologie / C3M
Mots clés : Adipose tissue, adipogenesis, mechanical force, mechanotransduction, mathematical modeling

Projet 4 : IDEX_MITO - Détection, classification et caractérisation de réseaux mitochondriaux : application à la maladie d’Alzheimer et au cancer
Porteurs : X Descombes / Informatique / INRIA - M Chami / Biologie / IPMC - F Bost / Biologie / C3M
Mots clés : Mitochondrie, Alzheimer, Cancer, Imagerie, Modélisation, machine learning, perturbateur endocrinien

Projet 6: I2MD - Identification of inhibitors disrupting MITF interactions with DNA
Porteurs : A Burger / Chimie / ICN - C Bertolotto / Biologie / C3M
Mots clés : Biologie, Chimie, MITF, inhibition, fluorescence, polyamides

Projet 7 : REDAC - Recherche et caractérisation de drogues anti-invasion cancéreuse
Porteurs : M Franco / Biologie /  IPMC - M Mehiri / Chimie / ICN
Mots clés : Drogues anti-cancéreuses, petite protéine G, invasion, Biochimie, synthèse chimique, criblage de molécules

Projet 8 : DEMOTECH - Développement de molécules pour la thérapie des hémopathies chimiorésistantes
Porteurs : A Martin / Chimie / ICN - G Robert / Biologie / C3M - T Cluzeau / Médecine / Hématologie clinique du CHU de Nice
Mots clés : Hémopathies, syndrômes myélodysplasiques, résistances, inhibiteurs, anticancéreux

Projet 9 : COMICS - Identification de composés immuno-stimulateurs antimicrobiens de nouvelle génération
Porteurs : T Michel / Chimie / ICN - L Boyer / Biologie / C3M
Mots clés : Parasite, Leishmaniose, substance naturelle, immunostimulation

Projet 8 : mTRANS - Role of distance and energy in vectorial lipid transport
Porteurs : G Drin / Biologie / IPMC - A Seminara / Physique / INPHYNI
Mots clés : Transfert proteins, lipid gradient, in vitro assays, distance, microfluidics

Projet 9 : mMpH - Fast measurements of intracellular pH using microfuidic systems
Porteurs :  L Counillon / Biologie / LP2M -  X Noblin / Physique / INPHYNI
Mots clés : pH dynamics, microfluidics, modelisation  

Projet 10 : NMLA-scRNASEQ - New machine learning approaches for single cell RNA seq analysis
Porteurs : A Paquet / Biologie / IPMC - M Barlaud / Informatique / I3S
Mots clés : Single cell, RNASeq, big data, machine learning, gene network, biostatistics, deconvolution, airway epithelium diseases
 

Action 2


COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION DE NOUVELLES EQUIPES DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Deux jeunes équipes ATIP/Avenir se sont installées à l'Institut de Biologie de Valrose (iBV) depuis Juin 2016.
Ces deux équipes sont co-financées par l'Académie 4 pour leur première année d'installation.

1- Equipe ATIP/Avenir installée à l'iBV dirigée par 

Arnaud HUBSTENBERGER (CR1 CNRS) 

de l'UPMC PARIS (FRANCE), reçu au concours CNRS en juin 2016.
Projet ET - Epi-Transcriptomics: RNP multiscale organization, phase transitions, and the adaptive regulations of gene expression during early development.
Objectifs: Comprendre comment les acides nucléiques s'organisent à grande échelle pour coordonner l'expression des gènes / To understand how nucleic acids organize on a large scale to coordinate gene expression.
Mots clés : Biophysics of RNP states and phase transitions, Cell biology of RNP complexes, Genetics in C. elegans, Developmental biology of the germline and the early embryo, System biology of RNP co-assembly, Transcriptomics Structural biology of intrinsically disordered protein regions and prion domains, RNA Posttranscriptional regulations of gene expression.
Site Webhttp://ibv.unice.fr/research-team/hubstenberger/

RNP coassemblies in C. elegans germline.
RNP coassemblies in C. elegans germline. Successive magnifications, scaling from C. elegans nematode to cytoslic RNP granules. Two sub-types of granules, germ granules in red and germline P-bodies (grPB) in green, are visualized by fluorescence in live animals (Dash lines delineate nuclei (N)).



2- Equipe ATIP/Avenir installée à l'iBV dirigée par

Matteo RAUZI  (CR1 CNRS)

de l'EMBL HEIDELBERG (GERMANY), reçu au concours CNRS en juin 2017.
Projet : SEPPMM - Subcellular Properties and Emerging Embryo-scale Mechanics driving Morphogenesis.
Objectifs: Comprendre comment les forces biophysiques sont générées et comment elles fonctionnent pour produire des formes tissulaires minutieusement précises et controlées durant le développement embryonnaire / To understand how biophysical forces are generated and how they work to produce exquisitely precise and controlled tissue shape changes in embryo development.
Mots clés: Morphogenesis, mechanics, gastrulation, contractility, epithelial folding.
Site Webhttp://ibv.unice.fr/research-team/rauzi/

Different steps of mesoderm invagination.
Different steps of mesoderm invagination. (a) initial state, (b) tissue flattening, (c) furrow formation, (d) furrow internalization. The staining marks mesoderm cells that are positioned on the ventral side (bottom) of the embryo. Readapted from (1).(a) initial state, (b) tissue flattening, (c) furrow formation, (d) furrow internalization. The staining marks mesoderm cells that are positioned on the ventral side (bottom) of the embryo. Readapted from (1).

 

Action3


ANIMATION SCIENTIFIQUE DE L'ACADEMIE 4

5 projets de conférence et 1 projet de venue de professeur invité ont été financés par l’Académie 4 après évaluation par des membres du conseil scientifique de l'Académie.

Projet 1 : ONCOAGE_MD ANDERSON - 2nd symposium ONCOAGE-MD ANDERSON: 1st joint meeting on lung cancer
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) :  6 au 7 Septembre 2018, au Centre universitaire méditerranéen, NICE
Porteur : P Hofman (CHU Nice)
Mots clés : Cancer, vieillissement, senescence cellulaire, oncogériatrie, poumon, ORL, impact environnement et qualité de l'air, biobanking, immunothérapie, machine learning
Site web : https://www.oncoage.org/06-07-september-2018-joint-meeting-on-lung-cancer/

Projet 2 :  CFC-2017 - 10ème meeting cils, flagelles et centrosomes, 2017
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 10 au 12 octobre 2017, hôtel Saint Paul (NICE)
Porteur : L E Zaragosi-Rathelot (IPMC)
Mots clés : Cils, centrioles, ciliopathies, cancer 
Site web : http://univ-cotedazur.fr/events/cfc2017

Projet 3 : NICE RNA 2018 - The multiple facets of RNA in health and disease
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 7 au 9 février 2018, Grand château Valrose
Porteur : B Mari (IPMC)
Mots clés : RNA metabolism, non-coding RNA, splicing, nuclear architecture, next generation sequencing, rare diseases, cancer
Site web : http://univ-cotedazur.fr/events/rna2018/

Projet 4 : COLT - Colloque sur le temps
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 7 au 9 Juin 2018, Campus Valrose et CUM
Porteur : A GUYON (IPMC)
Mots clés : Temps physique, astronomique, géologique, biologique, psychologique, artistique, rythmes, horloges, durée, synchronisation
Site web : http://univ-cotedazur.fr/fr/idex/academies/complex-systems/contents/projects/spare

Projet 5 : CareerEXPO2018 - CareerEXPO2018 is an annual exchange and networking event for PhD candidates and young researchers along with industry professionals.
Colloque avec conférenciers invités.
Lieu(x) et Date(s) : 9 mars 2018, campus Saint Jean d'Angely, NICE
Porteur : association IGBio de l'Ecole Doctorale SVS85 (LPMM, IRCAN, IPMC, LABEX SignaLife, ICST, DISTALZ, UNS)
Comité d'organisation étudiant : Auréa COPHIGNON / LP2M - Tomás DE GARAY / IRCAN - Sanya Eduarda KUZET / IRCAN - Racha Fayad  / IPMC
Mots clés : Career development, PhD, networking
Site web : https://www.igbio-uca.com/careerexpo

Projet 6 : APHA - Accueil Pr Heinz Arnheiter, MD, scientifique émérite
Professeur invité avec conférences dispensées.
Lieu(x) et Date(s) : Sept-Oct 2018, C3M
Porteur : C Bertolotto (C3M)
Mots clés : Biologie, découverte, MITF, éditeur en chef

Professeur invité Heinz Arnheiter MD Emeritas
Professeur invité Heinz Arnheiter MD Emeritas

Heinz Arnheiter est un chercheur émérite du National Institutes of Health (NIH) aux États-Unis et est actuellement rédacteur en chef de la revue Pigment Cell and Melanoma Research. Il est ressortissant suisse et a obtenu son doctorat de l'Université de Zürich en 1978. Il a ensuite travaillé comme chercheur à l'Institut d'immunologie et de virologie à Zürich. En 1981, il a déménagé au Laboratoire de Génétique Moléculaire au NIH où il a été le premier chercheur. En 1988, il est devenu chef de la section «Pathogenèse Virale» et en 1995 de la section «Développement des Mammifères». Dans les premiers stades de sa carrière, il a étudié la relation entre les virus et le système immunitaire, mais ensuite, lors d'une observation fortuite, sa recherche est passée de l'Immunologie au Développement.
Dans le cadre de sa venue à l’Université Côte d’Azur, Pr Heinz Arnheiter a donné une série de séminaires dont certains visant plus spécifiquement les doctorants et post-doctorants de l’Université de Nice Côte d’Azur afin de partager ses connaissances scientifiques, son expérience en tant qu’éditeur en chef d’un journal et son expertise dans la construction d’un document scientifique. Il est reconnu pour la découverte de la protéine MITF qui joue un rôle clé dans le développement et la fonction du lignage mélanocytaire mais qui est également impliquée dans la fonction des ostéoclastes, des mastocytes et des cellules immunitaires. La venue du Pr Heinz Arnheiter a intéressé plusieurs autres équipes de l'Université Côte d'Azur travaillant dans ces domaines.