Physiopathologies and Pharmacology

Retrouvez ci-dessous le descriptif des UE obligatoires et optionnelles du parcours Physiopathologie et Pharmacologie

Enseignements obligatoires en M1

UE 03 Physiopathologie et médecine moléculaire

Responsable : Raphael RAPETTI-MAUSS (rrapettima@univ-cotedazur.fr)

Niveau souhaité : M1 ou M2

Objectifs : Comprendre les bases moléculaires des pathologies afin de penser les nouvelles approches diagnostiques et thérapeutiques

Thèmes abordés :

Physiologie des Epithelia et pathologies associées (Dr R. Rapetti-Mauss)
Pathologies inflammatoires du tube digestif ; Mucoviscidose (Dr R. Rapetti-Mauss)
Glycémie, diabète et Canaux ioniques (Dr R. Rapetti-Mauss)
Développement et bioélectricité (Dr. O Soriani)
Canaux uonique et réponse immunitaire (Dr. O Soriani)
Physiologie du Globule Rouge (H. Guizouarn)
Pathologies du globule rouge : paludisme et anémies familiales (H. Guizouarn)
Activité électrique cardiaque : infarctus et remodelage de la signature électrique (J.M Mienville)
Adressage des CI (D. Bichet)


Modalités du contrôle des connaissances :
Contrôle continu (70%)
Présentations orales (30%)

UE19 Endocrinologie moléculaire et physiopathologie

Responsable : Michèle Teboul (Michele.Teboul@univ-cotedazur.fr)

Intervenants  : Michèle Teboul, Franck Delaunay, Pierre Léopold, Brigitte Sibille, Emmanuel Van Obberghen (prof de médecine), Jean-François Tanti, Jean-Louis Nahon

Thèmes abordés :

• Les rythmes biologiques en endocrinologie 3
• Les récepteurs aux oestrogènes, agonistes et antagonistes, intérêt dans le traitement du cancer du sein et de l’ostéoporose
• Les récepteurs aux glucocorticoïdes
• Les récepteurs aux hormones thyroïdiennes
• Les récepteurs nucléaires orphelins, interaction avec la signalisation hormonale
• Les récepteurs de rétinoïdes, interaction avec les récepteurs hormonaux
• Le contrôle de la croissance
• Les PPARs, mode d’action, agoniste et antagoniste, cibles thérapeutiques de désordres métaboliques
• Le diabète de type 2
• Les récepteurs LXR et FXR dans le métabolisme du cholestérol et l’athérosclérose
• Le contrôle de la prise alimentaire
• La signalisation de l’insuline

Modalités du contrôle des connaissances :
Session 1 : un examen de 3 heures avec 2 sujets de 90 minutes chacun
Session de rattrapage : un examen écrit de 1h30

UE 23 Immunologie fondamentale

Responsable: Nicolas Glaichenhaus (glaichen@ipmc.cnrs.fr)

Intervenant : Nicolas Glaichenhaus (nicolas.glaichenhaus@univ-cotedazur.fr), Thomas Simon : simon@ipmc.cnrs.fr

Thèmes abordés :

• Les preuves de l'existence de la réponse immunitaire
• Les techniques courantes en immunologie
• Les organes lymphoïdes et les cellules de l'immunité
• Le complexe majeur d'histocompatibilité
• La différenciation et l'activation des lymphocytes T
• La différenciation et l'activation des lymphocytes B
• La capture et la dégradation des antigènes

UE 26 Pharmacologie de la molécule au médicament

Responsable : Patricia Lebrun (Patricia.LEBRUN@univ-cotedazur.fr)

Niveau souhaité : M1 et /ou M2

Objectifs : Comprendre les processus de découverte, la caractérisation et la mise sur le marché de nouveaux médicaments. Illustrations avec quelques grandes classes de médicaments.

Contenu : 40h Cours/TD sous formes de cours et d’analyse de documents/publications.

Thèmes abordés :

• Absorption, distribution, biodisponibilité (E. Macia)
• Test activité protéique, affinité (L. Counillon)
• Drug design (J. Golebiowski)
• Electrophysiologie (F. Duprat)
• Pharmacologie des récepteurs membranaires et des canaux ioniques (E. Deval)
• Pharmacologie de la douleur (E. Lingueglia)
• Pharmacologie des échangeurs Na+/H+ (L. Counillon)
• Pharmacologie du traitement du cancer (C. Onesto)
• Pharmacologie du diabète (P. Lebrun)

Modalités du contrôle des connaissance :
2 sujets (poids équivalent) sont réalisés (étude de documents).

Enseignements optionnels en M1

Une UE à choisir parmi :

UE 06 Neuro-immunologie

Responsable : Philippe Blancou (Philippe.BLANCOU@univ-cotedazur.fr)

Niveau souhaité : M1 ou M2

Pré-requis : aucun

Objectifs : Sensibiliser les étudiants aux interactions qui existent entre le système immunitaire et le système nerveux central et périphérique

Thèmes abordés :

• Interaction cellulaire et moléculaire entre le système nerveux central et immunitaire
  • Trafficking des cellules immunitaires dans le système nerveux central (N. Glaichenhaus)
  • Inflammation et activité neuronale (A. Guyon)
• Effet de l'inflammation sur le système nerveux
  • Maladies autoimmunes du système nerveux central (sclérose en plaque) ou périphérique (myasthenia gravis) (T. Simon)
  • Neuroinflammation et métabolisme (L. Davidovic)
  • Inflammation et douleur (E. Ingueglia / D. Fontaine)
  • Neuroinflammation et vieillissement (neurodementia, maladie de Parkinson) (J. Chabry)
• Effet du système nerveux sur l'inflammation
  • Contrôle de l'inflammation par le système nerveux (T. Simon)
• Nouvelles perspectives thérapeutiques dans le domaine de la neuroinflammation
  • L'électroceutique : l'électrostimulation pour combattre des maladies inflammatoires (T. Simon)
  • Immuno-psychiatrie (N. Glaichenhaus)

Modalités du contrôle des connaissances :
Un oral de présentation d'un projet + un écrit

UE 07 Statistiques appliquées à la biologie

Responsable : Marc Bailly Bechet

Objectif : L'objectif de cette UE est d'apprendre aux étudiants à prévoir leurs expérimentations et analyser leurs résultats en optimisant le traitement statistique de leurs données. Elle s'adresse aux étudiants des différents parcours, quel que soit le type de données obtenues. Seront traités par exemple les aspects plans d'échantillonnage et d'expérience, les analyses multivariées, GLM, etc ...

L'UE se déroulera sous la forme d'études de cas permettant d'utiliser et d'interpréter les outils statistiques les plus adaptés.

Laboratoire(s) associé(s) : UMR CNRS – INRA – UNS Interactions biotiques et Santé Végétale

Equipe pédagogique : P. Coquillard (MCU UNS), M. Bailly-Bechet (MCU UNS), M. Poirié (PR UNS), N. Ris (IR INRA), autres intervenants

UE 18 Signalisation cellulaire

Responsable : Julie MILANINI (Julie.MILANINI@univ-cotedazur.fr)

Niveau souhaité : M1

Pré-requis : UE de Biochimie et de Biologie cellulaire en Licence. Notions d’enzymologie

Objectifs : connaître les principales grandes voies de signalisation de la cellule eurcaryote en conditions normale et pathologiques

Thèmes abordés :

• Cycle cellulaire (J. Milanini)
• Récepteurs à activité et Tyrosine Kinase (J. Milanini)
• Trafic intracellulaire (P. Barbero)
• Adhérence et matrice extracellulaire (E. Van Obberghen-Schilling, )
• Récepteurs à 7 domaines transmembranaires (E. Macia)
• Petites protéines G (M. Franco)
• Dynamique membranaire (G.Drin)
• Apoptose (F. De Graeve)
• Révisions et/ou nouveau cours (J. Milanini et/ou un nouvel intervenant

UE 31 Neurobiologie cellulaire et moléculaire

Responsable : Jacques NOËL (Jacques.NOEL@univ-cotedazur.fr)

Niveau souhaité : M1 et /ou M2

Pré-requis : Niveau licence Sciences du vivant ou équivalent. M1 en sciences de la santé. Biologie cellulaire et moléculaire, bases de neuroanatomie.

Objectifs : Présentation des avancées les plus récentes des connaissances fondamentales sur les bases cellulaires et moléculaires de la biologie cellulaire et la physiologie des neurones et des cellules associées qui sous-tendent l’activité des réseaux de neurones, les fonctions nerveuses intégrées et le comportement. Cette approche sera présentée de manière intégrée à partir d’exemples choisis (différentiation des neurites, fonction de la synapse glutamatergique, LTP-4

LTD-STDP-homeostasie synaptique, hétéromérisation des RCPG, signalisation, cytokines-lymphokines…) en les appliquant à l’étude de réseaux de neurones, les interactions périphérie/cerveau et des fonctions nerveuses spécifiques (circuits impliqués dans la prise alimentaire en modèle mammifère, interactions entre le SI et le SNC dans des conditions physiologiques et physiopathologiques, le courtship chez la droso…). Les étudiants acquièrent les connaissances fondamentales qui leur permettent de comprendre la littérature scientifique en neuroscience et poursuivre leurs études en doctorat de neuroscience.

Thèmes abordés :

• Polarité cellulaire
• Croissance axonale
• Neurosécrétion
• Synapse glutamatergique
• Fonction synaptique
• Plasticité
• Réseaux de neurones
• Hétéromerisation des récepteurs associés au changement de comportement
• Neuroimmunologie et neuroinflammation
• Neuroendocrinologie
• Neuro-immuno pathologies

Méthodologies : Technologies de génétique et biologie cellulaire pour la dissection de la fonction des circuits neuronaux (imagerie temps réel, morphing, serial reconstructions en EM, méthode graasp, rapporteurs pour imagerie calcique, optogénétique, électrophysiologie, pharmacologie…). Modèles animaux murin et drosophile.

Particularités : Certains cours,  pourront être en anglais et pédagogie innovante (e.learning).

Les UE de Neurobiologie de la Cognition et des Emotions, Neurobiologie des Maladies cérébrales et mentales sont des UE connexes.

Modalités du contrôle des connaissances :
Examen écrit, 2 sujets, avec documents papiers autorisés.

UE34 Introduction à la bio-info par la programmation

Responsable : Jean-Paul Comet (Jean-Paul.COMET@univ-cotedazur.fr), Professeur des universités - Laboratoire I3S - Section CNU 27

Objectifs :

La bio-informatique est un champ de recherche multi-disciplinaire (biologie, informatique, mathématiques, physique...) dont le but est de répondre aux besoins nouveaux d'analyse et d'interprétation des informations générées par les biotechnologies. La bio-informatique est constituée par l'ensemble des concepts et des techniques nécessaires à l'interprétation informatique de l'information biologique. La programmation informatique est un bon moyen pour aborder cette discipline.

L’objectif de cet enseignement est d’apprendre à manipuler des données simples grâce à un ordinateur. Aucun prérequis n'est demandé, ce cours s'adresse à tout étudiant qui désire comprendre comment manipuler informatiquement des données biologiques. L'étudiant aura acquis au cours de cet enseignement les bonnes méthodes et aura les compétences pour manipuler des données plus riches. 7

Thèmes abordés :

Ce cours se focalise sur l'apprentissage de la programmation en Python, ce qui permettra aux étudiants d'aborder par la suite bio-Python sans grande difficulté. Les différents points abordés seront :

• Introduction à la programmation
• Structures de données simples
• Expressions conditionnelles
• Définition de fonctions et procédures
• Les listes et les dictionnaires

La moitié de l'enseignement se fera autour de Travaux Dirigés qui permettront aux étudiants de se confronter à l'ordinateur. Les exemples pris relèveront de l'analyse des séquences biologiques.

Enseignements obligatoires en M2

UE02 Nutrition, inflammation et métabolisme

Responsables : Brigitte Sibille ((brigitte.sibille@univ-cotedazur.fr) et Michèle Teboul (michele.teboul@univ-cotedazur.fr)

Niveau souhaité : M2

Pré-requis : Notions d’endocrinologie, de métabolisme, de Biologie moléculaire et cellulaire, de physiologie et de Biotechnologies (animaux et cellules OGM…)

Objectifs : Le lien entre l’alimentation et la santé ne saurait être contesté. L’objectif de cette UE est de comprendre les régulations de la balance énergétique et les conséquences d’une alimentation et/ou d’une activité physique inadaptée(s) sur l’apparition de pathologies chroniques en relation avec la nutrition (maladies cardio-vasculaires et hépatiques, obésités, diabètes, athérosclérose, certains cancers…).

Thèmes abordés :

• Nutrition :
  • Métabolisme périnatal : régulation du métabolisme glucido-lipidique périnatal, relation mère-fœtus (B. Sibille)
  • Les effets transgénérationnels : nutrition et épigénétique (M. Teboul)
  • Besoins nutritionnels, nutrition et métabolisme : besoins nutritionnels chez l’Homme, importance du régime alimentaire dans la prévention des pathologies (M. Teboul)
  • Nutrition et activité physique : nutrition activité physique et régulation métabolique (AS. Rousseau)
  • Comportement alimentaire : contrôle par les neuropeptides et hormones, pathologies du comportement alimentaire (anorexie, boulimie, etc) (M. Teboul)
  • Digestion : digestion des lipides/protéines/glucides (M. Teboul)
• Régulations métaboliques :
  • Bioénergétique mitochondriale et métabolisme : rôle de la mitochondrie et de son efficacité dans la régulation du métabolisme cellulaire (B. Sibille)
  • Les PPARs et le métabolisme lipidique : rôle des PPARs dans la régulation du métabolisme lipidique, utilisation d’activateurs des PPARs dans le traitement du syndrome métabolique (B. Sibille)
  • Immuno-métabolisme : rôle de l'immunité sur le métabolisme et du métabolisme sur la fonction des cellules immunitaires. Métabolisme des cellules immunitaires comme cible thérapeutique des pathologies métaboliques (B. Sibille)
  • Métabolisme et cancer : métabolisme de la cellule cancéreuse, métabolisme comme cible thérapeutique (M. Teboul)
  • Rythme circadien et métabolisme : importance du rythme circadien dans le métabolisme énergétique, pathologies associées aux dérèglements du rythme circadien (M. Teboul)
• Pathologies métaboliques :
  • Le microbiote intestinal : importance du microbiote intestinal, dysbiose et pathologies associées, les pistes thérapeutiques pour modifier la composition du microbiote (M. Teboul)
  • Conférences chercheurs : intervention de chercheurs sur des points d'actualité en métabolisme

Modalités du contrôle des connaissances :
Session 1 : un examen de 3 heures avec 2 sujets de 90 minutes chacun
Session de rattrapage : un examen écrit de 1h30

UE24 Immuno-Pathologie

Responsable : Thomas Simon (simon.ipmc.cnrs.fr)
Nécessite d’avoir suivi l’UE23 ou de maitriser les bases fondamentales d’immunologie

Intervenants : Nicolas Glaichenhaus, Philippe Blancou, Thomas Simon, Antoine Sicard
Tous les intervenants appartiennent au laboratoire UMR7572 CNRS/UCA (Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire).

Thèmes abordés :

Immunité contre les protozoaires (Leishmania major) Immunité anti-bactérienne : Listeria, Salmonella, Mycobacterium tuberculosis

Analyses d'articles scientifiques pour tous les domaines de recherche mentionnés ci-dessus :

• Immunité anti-virale
• Diabète autoimmun
• Asthme et allergie
• Tolérance néonatale
• Immunité anti-tumorale, vaccination
• Immunité anti-VIH

UE 25 Nouvelles approches thérapeutiques

Responsable : Michèle Teboul (Michele.Teboul@univ-cotedazur.fr)

Intervenants et équipes de recherches associées : Michèle Teboul, Franck Delaunay, Isabelle Mus-Veteau, Sabine Lindenthal, Joelle Chabry, Thierry Virolle, Valérie Pierrefite-Carle, Nathalie Rochet, Catherine Heurteaux

Thèmes abordés :

• La chronothérapeutique des cancers
• Système circadien et métabolisme
• Le vieillissement- les sirtuines
• Les maladies du prion
• Les cellules souches et thérapie cellulaire
• Les cellules souches et cancer
• Ingenierie tissulaire osseuse-biomatériaux
• Exploration des pathologies cérébrovasculaires et thérapeutique
• Transporteurs en Imagerie et Radiothérapie Oncologique
• Vaccins thérapeutiques en cancérologie

Modalités du contrôle des connaissances :
Session 1 : un examen de 3 heures avec 2 sujets de 90 minutes chacun
Session de rattrapage : un examen écrit de 1h30

Enseignements optionnels en M2

2 UE au choix sur l'ensemble des UE du Master Sciences du Vivant

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