L'hybridation a façonné l'histoire de l'évolution de tous les règnes du vivant: on estime que 2 à 5 % du génome humain dérive d'événements archaïques de mélange et que plus de 10% du génome de certains poissons, plantes, papillons et taxons aviaires proviennent d'événements d'hybridation inter-espèces. Cependant, de nombreux hybrides ne sont pas viables ou sont des impasses évolutives en raison de leur stérilité intrinsèque, probablement due à la grande divergence de séquence entre les sous-genres parentaux et à l'incompatibilité entre les sous-ensembles de gènes. La fusion de sous-génomes parentaux très divergents qui ont évolué indépendamment pendant des millions d'années est censée déclencher un "choc génomique", une réponse à un défi génomique imprévu qui entraîne une restructuration du génome et une déstabilisation de la régulation des gènes. De manière surprenante, de nombreuses études sur les génomes hybrides existants ont montré que les génomes hybrides sont remarquablement stables, ce qui est inattendu, étant donné les signatures d'instabilité génomique passée qui caractérisent les hybrides. Ce projet vise à réconcilier ce paradoxe en étudiant les réarrangements génomiques et le remodelage de l’expression des gènes lors des premiers stades de l'hybridation inter-espèces en utilisant les levures Saccharomyces comme modèle.
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