Parcours - BIOINFORMATIQUE (BIOINFO) - (Licence sciences de la vie)

Parcours - BIOINFORMATIQUE (BIOINFO) - (Licence sciences de la vie)

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Résumé

L’objectif du parcours BioInfo est de conjuguer des bases théoriques et méthodologiques solides sur l’ensemble des domaines du vivant à des connaissances en informatique et mathématiques nécessaires pour mener à bien des projets de recherche. En savoir plus

Objectifs

Portail Sciences de la Vie
1er cycle (bac à bac+3) / Nice Campus Valrose

Détails

Présentation

A partir de connaissances solides acquises sur l’ensemble des domaines du vivant lors des 2 premières années de licence, le parcours BioInfo permet d’approfondir les fondamentaux qui régissent le vivant par une approche intégrée et d’acquérir les outils mathématiques et informatique nécessaires pour mener à bien des projets d’analyse et modélisation des systèmes biologiques /écologiques et/ou de gestion des données haut-débit. Le parcours Bioinfo initie à la recherche et laisse une part importante aux enseignements méthodologiques et pratiques afin de permettre aux étudiants d’appliquer les concepts théoriques et de les confronter à la démarche expérimentale.

Plus d'informations sur la Licence Sciences de la vie

La licence SV est généraliste et à vocation première la poursuite d’études en Master. Le parcours BioInfo donne accès à un grand choix de Masters locaux et nationaux dans différents domaines de la recherche en Biologie / Bio-informatique et permet aussi d’intégrer des écoles d’ingénieurs.

Pour un accès santé, choisir le parcours BioInfo-LAS  

L’acquisition de données biologiques massives et l’adaptation aux nouvelles contraintes de l’environnement nécessite l’utilisation d’outils de traitement des données et de modélisation des modèles biologiques performants. L'objectif du parcours BioInfo est de fournir aux étudiant(e)s les principes fondamentaux qui régissent le vivant par une approche multi-échelle allant du génome à l’organisme, et de les associer à des connaissances en algorithmie et structure des données et aux outils de la programmation. Le parcours BioInfo initie à la recherche et laisse une part importante aux enseignements méthodologiques et pratiques afin de permettre aux étudiant(e)s d’appliquer les concepts théoriques et de les confronter à la démarche expérimentale.

A l’issue de cette formation, l’étudiant(e) sera capable de résoudre à l’aide d’une démarche scientifique rigoureuse des questions biologiques en lien avec l’analyse de données haut-débits et/ou la modélisation de systèmes biologiques. La formation le(la) prépare aussi à un approfondissement, au niveau Master, des techniques dites de la bio-informatique et du « machine learning ». Le parcours Bio-Info donne accès à un grand choix de Masters locaux et nationaux dans différents domaines de la recherche en Biologie / Bio-informatique / Modélisation et permet aussi d’intégrer des écoles d’ingénieurs.

- Une formation qui apporte des connaissances approfondies en sciences du vivant grâce à une approche multi-échelle couplée à des bases d’informatique / Mathématiques.
- Un apprentissage à la démarche scientifique à l’aide d’enseignements intégrés alliant des approches académiques et appliquées basées sur des projets, des analyses d’articles scientifiques et des enseignements pratiques.
- Permet d’acquérir des outils transversaux comme l’anglais scientifique et la communication.
- Possibilité de suivre des modules préparant à l’insertion professionnelle.
-Possibilité de faire une partie de l’année ou l’année L3SV à l’étranger dans le cadre du programme ERASMUS+
- Le parcours s’appuie sur des enseignants-chercheurs intégrés dans le tissu de la recherche locale en lien direct avec la spécificité de parcours.

Christophe Bécavin: Coordinateur L3 parcours BioInfo

Christophe.BECAVIN@univ-cotedazur.fr

  • Grechez Aline et Mandon Karine: Directrices du portail SV et coordinatrices 3ème année
  • Garcia Isabelle : coordinatrice 2ème année
  • Deschaux Olivier : coordinateur 1ère année

Partenariats

Le parcours BioInfo se fait en partenariat étroit avec les laboratoires de recherche en Sciences du Vivant de la côte d’Azur rattachés à l’Ecole Universitaire de Recherche (EUR) Life and Heath Sciences : 

Et les entreprises locales participantes au conseil de perfectionnement de la licence telles que : 
- Syneos Health
- BIOVOTEC
- LifeScientis

Admission

Pré-requis

1er cycle (bac+2)

- L’admission en L3 parcours BioInfo est acquise de droit pour tout(e) étudiant(e) ayant validé une L2SV à l’université côte d’azur.
- L’admission en L3SV, est ouverte sur dossier aux étudiant(e)s ayant validé une L2 Science de la Vie dans une autre université Française, ou des étudiant(e)s titulaires d’un BTS, d’un DUT ou BUT, ou d’une seconde année validée de classes préparatoires.
- Une bonne adéquation de la formation post-bac initialement suivie avec la formation demandée est nécessaire.
- L’enseignement étant majoritairement donné en langue française, une connaissance du français niveau B2 minimum est nécessaire pour postuler.

Pour plus d’information sur l’accès dans le portail L1-L2 SV, se reporter à la formation « licence Sciences de la Vie »

Le parcours BioInfo s’adresse aux étudiant(e)s désireux d’acquérir des compétences dans les domaines de l’analyse de données haut-débit et la modélisation des systèmes biologiques. Il s’adresse aux étudiant(e)s ayant de bonnes connaissances en biologie (biologie cellulaire et génétique) et qui portent de l’intérêt pour l’informatique et les mathématiques. Le parcours BioInfo leur permettra d’acquérir les bases en informatique/mathématiques nécessaires pour poursuivre dans les Masters de bio-informatique, de « machine learning », et de modélisations appliquées aux sciences du vivant.

Pour plus d’information, se reporter au site : https://opencourses.univ-cotedazur.fr/course/view.php?id=142 (connexion en tant qu’anonyme (bas page))

Modalités de candidature

- Pour une entrée en L3, les candidatures se font sur la plateforme e-candidat UniCA
- Les étudiant(e)s éligibles à la plateforme « Etudes en France » doivent impérativement postuler via cette plateforme.
- Pour les étudiant(e)s ayant validé une L2SV à l’université Côte d’azur, l’inscription de droit s’effectue directement par le portail SV.

Les admissions se font en ligne via la plateforme e-candidat, ouverte de mi-avril à mi-juillet pour l’année universitaire suivante.

Modalités de candidature spécifiques

- Les étudiant(e)s ressortissant(e)s de l’UE doivent candidater via la plateforme e-candidat
- Les étudiant(e)s hors UE ressortissant(e)s des pays éligibles à la procédure « Etudes en France » doivent obligatoirement candidater via cette plateforme.
- Les étudiant(e)s hors UE ressortissant(e)s des pays non éligibles à la procédure « Etudes en France doivent candidater sur la plateforme e-candidat.
- Tout(e) candidat(e) souhaitant valider la licence en formation continue doit s’adresser au service « Azur formation » de l’université Côte d’Azur.

Conditions d'admission / Modalités de sélection

Le(la) candidat(e) doit avoir validé un niveau bac+2 en biologie générale, et montré un intérêt pour l’informatique et les mathématiques .

Programme

- L’année de L3SV débute le 1er septembre et se termine le 8 juillet.
- L’année se divise en 2 semestre d’environ 350h chacun.
- Chaque semestre comporte 5 Unités d’Enseignement (4 disciplinaires et 1 compétence transversale), chacune permettant d’acquérir 6 ECTS. La validation de 30 ECTS permet d’acquérir 1 semestre.

Des passerelles existent entre les parcours de la L3SV. Il est possible également de suivre une UE à visée professionnelle par semestre en plus.

- L’année est organisée par l’équipe de pilotage de la licence constituée des responsables d’année de L1SV, L2SV, L3SV et des parcours de la L3SV.

 - Les enseignants sont majoritairement des enseignants-chercheurs titulaires. Ils sont aidés par des enseignants moniteurs, qui réalisent leur doctorat au sein des laboratoires rattachés à l’université Côte d’Azur. Des attachés temporaires d’enseignement et de recherche (ATER) peuvent aussi intervenir.

Temps plein

- L’enseignement est réparti sur 2 semestres comportant 30 ECTS chacun et comporte des cours magistraux, des travaux dirigés et pratiques ainsi que de nombreux projets.
-Le premier semestre se déroule du 1er septembre à la première quinzaine de janvier.
- Les enseignements théoriques se terminent généralement mi-novembre de manière à laisser la place aux enseignements pratiques de fin novembre à mi-décembre.
- Les 2 dernières semaines du semestre impair sont réservées pour les examens terminaux.
- Le second semestre se déroule de mi-janvier à fin mai.
- Les enseignements théoriques se terminent généralement mi-avril de manière à laisser la place aux enseignements pratiques fin avril.
- Les 2 dernières semaines du semestre pair sont réservées pour les examens terminaux.
- Une session « seconde chance » se déroule courant juin

Et après ?

- Après la L2, les étudiants pourront poursuivre en L3 SV, s’orienter vers une licence professionnelle ou intégrer une école d’ingénieur 

- La licence SV est une licence généraliste à vocation première la poursuite d’études en Master. Le parcours BioInfo donne accès à un grand choix de Masters locaux et nationaux dans différents domaines de la recherche en Biologie/Bioinformatique/Modélisation et permet aussi d’intégrer des écoles d’ingénieurs.

- Au niveau local, le parcours BioInfo prépare au Master Sciences du Vivant (parcours Bio-Informatique ; Cancérologie et Recherche Translationnelle) et à différents diplômes d’établissement (Masters of Sciences) de l’université Cote d’Azur qui portent sur des domaines aussi variés que la conservation d’échantillon dans les biobanques (Msc Biobanks), la modélisation en neurologie (Msc Mod4NeuCog), gestion de l’environnement que ce soit terrestre et la santé des plantes (Msc BOOST) ou marin (Msc MARRES).

Secteurs d'activité ou type d'emploi

A l’issue de la licence SV, les diplômés peuvent directement accéder à des emplois dans les laboratoires publics ou privés dans les secteurs des industries pharmaceutiques ou agroalimentaires, de l’environnement ou de la santé en fonction de l’option animale ou végétale choisie. L’insertion se fait à un niveau technicien en tant que :

- Technicien(ne) de laboratoire en recherche et développement
- Technico-commercial
- Animateur Scientifique
- Les concours de la fonction publique Catégorie B sont également accessibles (technicien de recherche et de formation).