M. Mickael Ohanna

Disciplines enseignées

• Bioinformatique appliquée à la biologie cellulaire et au cancer

• Analyse de données transcriptomiques (RNA-seq, microarrays) et intégration de données publiques (GEO, TCGA, cBioPortal)

• Utilisation d’outils et logiciels pour l’étude des réseaux de signalisation et de la plasticité tumorale (Cytoscape, R, GSEA)

• Approches de biostatistique et visualisation de données pour l’interprétation des résultats expérimentaux

• Formation des étudiants à l’analyse critique et à la valorisation de données en lien avec la cancérologie translationnelle

Thèmes de recherche

Mes travaux portent sur la compréhension des mécanismes de plasticité phénotypique et de résistance thérapeutique dans le mélanome cutané, une des formes les plus agressives de cancers de la peau. Ces recherches s’inscrivent à l’interface entre signalisation oncogénique, métabolisme, régulation épigénétique, sénescence et contrôle post-traductionnel des protéines, avec une forte dimension translationnelle visant à identifier de nouvelles cibles thérapeutiques.

�� Plasticité tumorale et transition phénotypique
Les cellules de mélanome alternent entre un état prolifératif, dépendant de MITF, et un état invasif caractérisé par l’expression de facteurs tels qu’AXL, ZEB1 ou SOX10. Ces transitions conditionnent la migration, l’invasion et la dissémination métastatique. J’ai contribué à démontrer le rôle de réseaux transcriptionnels et de voies de signalisation majeures (MAPK/ERK, PI3K/AKT, NF-κB, TGF-β) dans ce basculement et leur impact sur la résistance aux inhibiteurs de la voie MAPK.

�� Métabolisme et adaptation thérapeutique
Pionnier dans l’étude de la voie mTOR et de son rôle dans la régulation de la croissance, du métabolisme et de la taille cellulaire (Nat Cell Biol 2005 ; PNAS 2006 ; AJPCP 2007), j’ai ensuite élargi ces recherches au contexte du mélanome. Nous avons montré que NAMPT et le métabolisme du NAD+ jouent un rôle central dans le basculement vers un phénotype invasif et résistant. De plus, nous avons étudié SIRT1, une déacétylase NAD-dépendante, qui favorise la prolifération et inhibe la sénescence, établissant un lien direct entre métabolisme énergétique et régulation épigénétique.

�� Sénescence et secretome tumoral
Un autre axe majeur de mes travaux concerne la sénescence cellulaire et ses effets paradoxaux dans le mélanome. Nous avons montré que les cellules sénescentes développent un secretome pro-tumoral activant notamment la voie STAT3, capable de reprogrammer des cellules de mélanome naïves vers un état initiateur tumoral. Nous avons aussi décrit l’implication de PARP1 et NF-κB dans ce secretome et exploré le rôle de MITF dans la régulation de la sénescence. Ces résultats mettent en évidence l’importance de la sénescence induite par les traitements dans la progression tumorale et les résistances.

�� Mécanismes épigénétiques et microenvironnement
Nous nous intéressons au rôle des variants d’histones (H2A.Z, H3.3) et des modifications post-traductionnelles (PTM) des histones (acétylation, méthylation, ubiquitinylation) dans le remodelage de la chromatine, la régulation de l’expression génique et la plasticité tumorale. L’influence des microARNs (miR-34a, miR-143/145) et du microenvironnement tumoral complète ce champ, montrant comment des signaux fibrotiques et inflammatoires modulent la réponse aux traitements.

�� DéUBiquitinases (DUBs) et régulation post-traductionnelle
Plus récemment, mes recherches se sont élargies à l’étude des DUBs (USP14, USP39, etc.), qui régulent la stabilité et l’activité de protéines clés impliquées dans la migration, l’invasion et la survie cellulaire. Ces enzymes apparaissent comme des cibles thérapeutiques innovantes pour contrer la progression du mélanome et des hémopathies malignes.

�� Axes translationnels et thérapeutiques
Mes travaux s’appuient sur des approches intégrant la biologie cellulaire et moléculaire, des assays fonctionnels (migration, invasion, sénescence), la bioinformatique (RNA-seq, analyses sur données publiques) et des modèles in vivo. L’objectif est de développer des stratégies combinatoires ciblant simultanément le métabolisme, l’épigénétique, la sénescence et la régulation post-traductionnelle afin de surmonter la résistance aux thérapies actuelles et d’améliorer la prise en charge des patients atteints de mélanome.

Parcours:

• 2014-présent – Nomination au rang de CRCN- INSERM
• 2009-2013 – Post-doc, C3M U1065, Nice, équipe du Dr Robert Ballotti.
• 2006-2009 – Post-doc, ISDBC UMR 6543, Nice, équipe du Dr Pierre Lepold.
• 2003-2006 – Phd student, U584, Paris, équipe du Dr Mario Pende.