Microscopie Imagerie Cytométrie Azur

Microscopie Imagerie Cytométrie Azur (MICA) est une plateforme multi-sites et multi-tutelles, labellisée par le GIS IBISA en 2010. Elle est ouverte à l'ensemble des structures publiques et privées sans aucune condition thématique, institutionnelle ou géographique.

MICA mutualise les plateaux techniques en imagerie et microscopie de 8 partenaires en recherche académique sur la Côte d'Azur :

• Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC, UMR7275 CNRS / UniCA) - Sophia-Antipolis
• Institut de Biologie de Valrose (iBV, UMR7277 CNRS - Inserm U1091- UniCA) - Nice
• Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire (C3M, UMR 1065 Inserm / UniCA) - Nice
• Institut de la Mer de Villefranche (IMEV, CNRS/ Sorbonne Université) - Villefranche sur Mer
• Centre Commun de Microscopie Appliquée (CCMA, Université de Nice Sophia-Antipolis) - Nice
• Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN,UMR CNRS 7284- Inserm U1081-UniCA) - Nice
• Institut Sophia Agrobiotech PACA INRAE (UMR ISA INRAE1355-UniCA-CNRS7254 Sophia-Antipolis)
• L'équipe projet Morpheme (INRIA/I3S/iBV).

48 équipements spécialisés en microscopie (électronique, photonique, force atomique, micro-dissection laser)
11 équipements de cytométrie en flux (analyseur et trieur de cellules)
26 techniciens, ingénieurs et chercheurs porteurs de l'expertise scientifique et technique de la plateforme

MICA assiste et forme les équipes de recherche sur différentes techniques et méthodologies d’imagerie : analyse ultra-structurale par microscopie électronique, imagerie photonique super-résolue ou à force atomique, imagerie macroscopique à feuille de lumière, analyse statistique, tri de populations cellulaires et d’organismes planctoniques... L’originalité de la plateforme réside dans sa capacité à accueillir sur les équipements, aussi bien des échantillons provenant d’insectes et de végétaux (hyménoptères, racine, feuilles, organes symbiotiques ou pathologiques) ou d’organismes marins (ascidie, plancton, méduse), que des échantillons cliniques (pièces anatomiques, tissus…).

La plateforme MICA adapte et développe à façon des approches techniques ou méthodologiques, depuis l’observation jusqu’à l’analyse d’images. Elle propose également un accès à la base de données de taxonomie Ecotaxa et à la base Omero de gestion de projets et d’édition d’images commune avec EMBRC France.

Nanoscopie :

• Analyse ultra-structurale en microscopie électronique à transmission et balayage (immunocytochimie à l’or colloïdal, cryobservation, cryofracture), microscopie 3D par coupes sériées, analyse chimique par EDX,
• Caractérisation topographique et analyse de propriétés mécaniques en microscopie à force atomique (contact, tapping, peak force tapping dans l’air et en milieu liquide),
• Imagerie photonique super-résolue PALM et STED.

Imagerie photonique subcellulaire et cellulaire :

• Mise à disposition de vidéo-microscopies en contraste et fluorescence 4D, microscopie confocale spectrale et rapide, microscopie TIRF, imagerie calcique, imagerie multi-photonique et de seconde harmonique,
• Analyse de mobilité subcellulaire par FRAP et FCS/ FCCS,
• Analyse de localisations et interactions moléculaires, mesure de durée de vie de fluorescence (FLIM).

Imagerie du tissu à l’organisme vivant :

• Imagerie de coupes de tissus en 2D et 3D,
• Transparisation d’organes et organismes,
• Imagerie à feuille de lumière sur échantillons fixés ou vivants, du millimètre au cm,
• Imagerie et classification taxonomique de plancton in situ et en laboratoire.

Analyse et tri de cellules par cytométrie en flux :

• Analyse multivariée,
• Cytométrie spectrale, en image et du plancton,
• Tri de petites particules et petits organismes,
• Tri pour le single cell et pharmacologique (développement).

Analyse d’images :

• Réalisation de solutions d’analyse d’images à façon en 2D, 3D et 4D,
• Mise à disposition de bases de données et de logiciels d’analyse 3D.