Projets financés

FINANCEMENT DE STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

En Juin 2024, 9 projets de recherche ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juillet 2024, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 5 projets ci-dessous à financer en 2024, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 2024_1.1 : OSCILLA12 - Analyse expérimentale et modélisation mathématique des oscillations biologiques de 12 heures
Porteur 1 : Franck Delaunay / Bio / iBV
Porteur 2 : Madalena Chaves / Info / INRIA
Mots clés : Boucles de rétroaction, oscillateurs, réseaux, rythmes ultradiens, XBP1

Projet 2024_1.5 : MARIN-KCNQ1 - Identification d’outils pharmacologiques innovants issus d’organismes marins pour moduler l’activité du canal potassique KCNQ1
Porteur 1 : Raphael Rapetti-Mauss /Bio / iBV
Porteur 2 : Mohamed Mehiri / Chimie / ICN
Mots clés : Produits Naturels Marins, KCNQ1, Pharmacologie

Projet 2024_1.6 : PatchedMecaTarget - Identification of the interaction site of Patched efflux inhibitors and mechanistic study
Porteur 1 : Stéphane Azoulay / Chimie / ICN 
Porteur 2 : Isabelle Mus-Veteau / Bio / IPMC
Mots clés : Chemistry, pharmacology, cellular biology, drug efflux pump inhibitor, chemotherapy resistance

Projet 2024_1.7 : REGENER - Large-scale identification of new players involved in axonal regeneration and robust morphometric quantification of axonal trees
Porteur 1 : Caroline Medioni / Bio / iBV
Porteur 2 : Grégoire Malandain / Info / iNRIA
Mots clés : axonal regeneration, genetic screen, confocal microscopy, axonal trees, detection algorithm, robust quantification

Projet 2024_1.8 : CHIRALIVE - Regulation of stress-induced chirality changes in a living organism
Porteur 1 : Agnes BANRETI / Bio / iBV
Porteur 2 : Uwe Meierhenrich / Chimie / ICN
Partenaire : Cornelia Meinert / Chimie / ICN
Mots clés : homochiral, heterochiral, D-amino acids, chirality regulating genes, enantiomer separation, enantioselective gas chromatography

COFINANCEMENT D'INSTALLATION DE NOUVELLES EQUIPES DE RECHERCHE EN BIOLOGIE SUR LE SITE D'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Bianca SILVA - IPMC

Louis-Félix NOTHIAS - ICN

Hervé TECHER - IRCAN
 

FINANCEMENT DE PROJETS D'ANIMATION SCIENTIFIQUE

Projet 2024_3.1 : CFATG12 - 12eme Congrès du Club Francophone de l’Autophagie
Porteur : Guillaume ROBERT / bio / C3M
Mots clés : Autophagie, Mécanisme & régulation, Physiopathologie , Infection & immunité, Cancer
19-21 Mars 2025, SAINT JEAN CAP FERRAT - https://cfatg.org/prochain_cfatg/cfatg12/

Projet 2024_3.2 : SNE2024 - 46eme colloque de la société de neuroendocrinologie - Colloque Joint France - Canada - SNE2024
Porteur : Carole ROVERE / bio / IPMC
Mots clés : Colloque scientifique internationale, société, santé, vieillissement, nutrition, métabolisme, rythmes circadiens, environnement
16-19 septembre 2024, NICE - https://www.sne2024nice.com/

Projet 2024_3.3 : EMBO_REG - 2024 EMBO workshop “The molecular and cellular basis of regeneration and tissue repair” 
Porteur : Eric RÖTTINGER / Bio / IRCAN
Mots clés : EMBO, international workshop, Regeneration, Tissue repair, Philosophy, History
7 – 11 October 2024, SAINT JEAN CAP FERRAT - https://meetings.embo.org/event/24-tissue-repair

Projet 2024_3.4 : COCOO - Colloque et conférences de l'observatoire des médecines complémentaires non conventionnelles
Porteur : Véronique MONDAIN / santé / CHU NICE
Mots clés : Interventions non médicamenteuses, pratiques complémentaires, médecine intégrative, colloque, conférence, formation, enseignement, recherche
https://www.omcnc.fr/nos-evenements

Projet 2024_3.7 : GDR MNF - Journées plénières du GDR MicroNanoFluidique
Porteur : Céline COHEN / Physique / INPHYNI
Mots clés : microfluidique, nanofluidique, physique des fluides, biophysique, chimie, médecine, microfabrication, bioinformatique
18-19 nivembre 2024 NICE Hotel Saint Paul - https://www.gdrmicrofluidique.com/#
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​​​​Projet 2024_3.8 : ICON-W - NonlInear Cell PhotONics Workshop Research
Porteurs : Frédéric BRAU / Bio / IPMC - Caroline MEDIONI / Bio / iBV - Gian Luca Lippi / INPHYNI - Stéphane Lanteri / INRIA
Mots clés : interdisciplinary workshop, biophotonics, international, optogenetic, microfluidics
2-4 avril 2025 -

Projet 2024_3.9 : CRISPR-DAY 2024 - One-day meeting : CRISPR screening in Cancer Discovery
Porteur : Bernard MARI / Bio / IPMC 
Mots clés : Crible CRISPR / Cas 9, Génomique Fonctionnelle, Cancérologie, Bioinformatique, apprentissage automatique (« machine learning »)
24 sept 2024 Paris - https://siric.institut-curie.org/events/meetings/national-day-dedicated-crispr-screening-september-24-2024

Projet 2024_3.10 : IRN France-Taiwan - Rencontre scientifique Franco-Taiwanaise sur les canaux ioniques d’intérêt thérapeutique et la biologie marine
Porteur : Emmanuel DEVAL / Bio / IPMC
Mots clés : canaux ioniques, biologie marine, physiopathologie, réseau international, Taiwan, échanges, symposium
24-25 Octobre 2024, grand château du campus valrose NICE 

Projet 2024_3.11 : BAW_UniCA_2025 - Semaine du Cerveau sur la Côte d’Azur 2025 (Culture scientifique / Recherche participative – Science et Société)
Porteur : Jacques NOEL & Carole ROVERE / Bio / IPMC
Mots clés : Cerveau, Culture scientifique, Science et Société, partenaires UCA, interdisciplinarité.
10-16 mars 2025, NICE - https://www.semaineducerveau.fr/programme-manifestations/

Projet 2024_3.12 : SID3 - Symposium Inflammation & Disease (3rd edition) research conference
Porteur : Jean-Ehrland RICCI & Sandrine MARCHETTI / Bio / C3M
Mots clés : inflammation, cancer, chronic diseases, translational research, international
7-8 novembre 2024 Hospital ARCHET2 Amphitheater, NICE -

COFINANCEMENT D'UNE THESE INTERDICIPLINAIRE

Thèse cofinancée par l'Académie 4 & l'EUR LIFE : Julie TE - ICN
 

STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

En Mai 2023, 11 projets de recherche ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juin 2023, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 6 projets à financer en 2023 ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 2023_1.1 :  FRAMBOMIX-S - A multi-OMICs integrating analysis for a global comprehension of splicing alterations in the etiology of the Fragile-X Syndrome
Porteur 1 : Carole GWIZDEK Bio IPMC
Porteur 2 : Silvia BOTTINI Maths & Info MSI
Mots clés : Fragile-X Syndrome, multi-OMICs integrating analysis, FMRP nuclear functions, mRNA splicing, bioinformatics, variational autoencoders, machine learning

Projet 2023_1.2 :  MathArchi - Caractérisation de l’architecture de la lame basale par analyses mathématiques d’images 3D
Porteur 1 : Frédéric LUTON Bio IPMC
Porteur 2 : Xavier DESCOMBES info INRIA
Mots clés : invasion, lame basale, architecture, reconstruction 3D, analyses d’images, apprentissage machine

Projet 2023_1.3 :  CCQ - Characterization and quantification of cell geometry and topology changes in urchin invagination
Porteur 1 : Matteo RAUZI Bio IBV
Porteur 2 : Gregoire MALANDAIN Info INRIA
Partenaires : CROCE/Jennifer.croce@imev-mer.fr / Bio LBDV

Projet 2023_1.5 :  I-serpine1 - Développement d’inhibiteurs de la serpine1 pour le traitement du cancer du rein
Porteur 1 : Maeva DUFIES Bio IRCAN
Porteur 2 : Cyril RONCO Chimie ICN
Mots clés : Serpine1, développement de petites molécules chimiques, nouvelle stratégie thérapeutique, Renal Cell Carcinoma (RCC)

Projet 2023_1.8 : KillRab - Identify compounds able to repress the Rab-dependent negative feedback loop on PPAR transcription to improve MAFLD therapies
Porteur 1 : GILLERON Jérôme Bio C3M
Porteur 2 : TOPIN Jérémie Chimie ICN
Mots clés : Rab protein / chemical structure / inhibitor / MAFLD / Liver

Projet 2023_1.11 :  Chemometric_RNP - Use of Chemometric Approaches to improve drug synthesis targeting Processing bodies
Porteur 1 : Patrick Brest Bio IRCAN
Porteur 2 : Christophe Di Giorgio Chimie ICN
Partenaires : Rete/ Tifenn.Rete@etu.univ-cotedazur.fr, Nicolini/ Victoria.Nicolini@hotmail.fr, Duca/ Maria.Duca@univ-cotedazur.fr
Mots clés : Processing bodies, biocondensats, criblage chimique, machine learning, approches chimiométriques
 
 

ANIMATION SCIENTIFIQUE

En Mai 2023, 4 projets de conférence ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 5 membres du conseil scientifique de l'Académie.
En Juillet 2023, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 3 projets de séminaires ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 2023_3.2 : JOBIM2023 - Conférence « JOBIM'23 IN NICE »
Porteur 1 : Karine Robbe Bio INRAE
Porteur 2 : Olivier Croce Bio IRCAN
Partenaires : Edoardo Sarti INRIA / Da Rocha Martine INRAE / Bottini MDLab MSI / Bécavin Christophe IPMC / Gautier Romain IPMC / Bailly-Bechet Marc INRAE
Mot clés : Transdisciplinaire, Biologie, Mathématiques, Informatique, Bioinformatique, Omiques

Projet 2023_3.3 : ICAWL - Collaboration / Visiting Scientist  : New tools for investigation of pH-dependent mechanisms of plant oomycete interactions (collaboration between INRAE, Université Côte d’Azur and Wageningen University Laboratories)
Porteur 1 : Eric Galiana Bio INRAE
Porteur 2 : Agnès Attard Bio INRAE
Partenaires : Carlotta Lupatelli Bio INRAE   / Edouard Evangelisti Wageningen University NL
Mots clés : Plant disease, Oomycete, Interaction, Infection, pH, Franco-Dutch collaborations

Projet 2023_3.4 : Nice-seq - An interactive genomic forum of the Nice bay area
Porteur 1 : Gianni Liti Bio IRCAN 
Porteur 2 : Chiara Vischioni Bio IRCAN
Mots clés : genomics, bioinformatics, computational biology, quantitative biology, molecular
evolution, multi-omics

En Sept 2023, 5 nouveaux projets de conférence ont été reçus par l’Académie 4 et ont été évalués chacun par au moins 4 membres du conseil scientifique de l'Académie.
Fin sept 2023, le comité de pilotage a validé la sélection finale des 4 projets de conférences ci-dessous, en prenant en compte le budget total à allouer et le classement de chaque projet.

Projet 2023_3.5 : RFRD - 19e Symposium du Réseau Français de Recherche sur le Douleur - 12-13 avril 2024
Porteur 1 :   Eric LINGUEGLIA Bio IPMC
Mots clés : douleur, réseau, national, international, recherche fondamentale, recherche clinique, symposium

Projet 2023_3.6 : COCOO - Colloque et conférences de l’OMCNC (L’Observatoire des Médecines Complémentaires Non Conventionnelles)
Porteur 1 :  Véronique MONDAIN Médecin CHU
Porteur 2 : Alice GUYON Bio shs Marseille
Mots clés : Interventions non médicamenteuses, pratiques complémentaires, médecine intégrative, colloque, conférence, formation, enseignement, recherche

Projet 2023_3.7 : DEVAGE -   EMBO workshop “Developmental Circuits in Aging” - 9 - 12 avril 2024, NICE, FRANCE
Porteur 1 :  Eric GILSON, Bio IRCAN 
Mots clés : Ageing, development, workshop, age-related diseases, biomedicine, ecophysiology, cell and molecular biology, stem cell, regeneration, genome maintenance, cell senescence.

Projet 2023_3.8 : BioIAS 2nd Edition - Second edition of the Biological Image Processing and Analysis - Fevrier 2024
Porteur 1 :  Ellen VAN OBBERGHEN-SCHILLING Bio iBV
Porteur 2 : Laure BLANC-FERAUD Info Laboratoire I3S
Mots clés : biological images, quantitative image analysis, microscopy, experimental and computational scientists

INFRASTRUCTURE PARTAGEE

Projet 2023 : ODIN - Omics Data Integration Network
Porteur : Lebrigand Kevin
Mots Clés : Analyse, bioinformatique, statistique, réseau, génomique, protéomique, multi-omique

 

THESES INTERDISCIPLINAIRES

Thèse cofinancée par Académie 4 - EUR LIFE : Adèle RIVAULT

Thèse cofinancée par Académie 4 - EUR HEALTHY : Julien MERCIER
 

STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

Projet 2022_1.2 :  SAIMITALZ - Application of symbolic artificial intelligence in mitochondrial dysfunctions studies in Alzheimer’s Disease.
Mounia CHAMI / Bio / IPMC / mchami@ipmc.cnrs.fr / 1 Master.
Gilles BERNOT / Info / I3S / 1 Master.
Jean-Paul Comet / BioInfo / I3S
Mots clés : Artificial Intelligence, Symbolic AI, Deep-learning, Alzheimer’s Disease, Mitochondria.

Projet 2022_1.3 : ChemoLip - Chemical manipulation of membrane lipid composition and functions.
Takeshi HARAYAMA / Bio / IPMC / 1 Master.
Mohamed MEHIRI / Chimie / ICN /1 Master.
Elisabeth Taffin-de-Givenchy / Chimie / ICN
Mots clés : Lipids, Membranes, Chemical biology, Lipidomics, Metabolism, Mitochondria, Signaling, Adipocytes.

Projet 2022_1.4 : NMAC-in-TiME - Developing methodologies to quantify Neuron-Macrophages interactions in the Tumor immune MicroEnvironment of cutaneous squamous cell carcinoma.
Fabienne ANJUERE / Bio / IPMC / anjuere@ipmc.cnrs.fr / 1 Master.
Xavier Descombes / Info / INRIA, I3S / 1 Master.
Véronique BRAUD / Bio / IPMC
Mots clés : Sensory neurons, macrophages, skin cancer, relapse, Imaging Mass cytometry, automatic image treatment, automatic cell segmentation, quantitative image analysis.

Projet 2022_1.5 : TAPROmiR - Investigating targeted therapies against prostate cancers using specific inhibitors of oncogenic miRNAs.
Maria Duca / Chimie / ICN, CNRS / maria.duca@univ-cotedazur.fr / 1 Master.
Michele TRABUCCHI / Bio / C3M, INSERM / 1 Master.
Audrey DI GIORGIO / Chimie / ICN
Mots clés : RNA binders, microRNA, prostate cancer, targeted therapy, inhibition, medicinal chemistry.

Projet 2022_1.7 : RIDAP - Régulation des canaux Ioniques Dans le stroma Des Adénocarcinomes Pancréatiques.
Olivier SORIANI / Bio / IBV / 1 Master.
Claude PASQUIER / Info / i3S / 1 Master.
Raphael RAPETTI-MAUSS / Franck BORGESE.
Mots clés : Cancer du pancréas ; Canaux ioniques ; SigmaR1 ; Cancer associated fibroblasts ; signalisation ; fouille de graphe attribués ; détection de communautés ; Intelligence Artificielle.

COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR
 

Aurélien BOISSON-DERNIER, PhD, ISA INRAE

 

ANIMATION SCIENTIFIQUE

Projet 3_2 : AWW - « L’anthracologie dans le monde : diversité des contextes et des milieux. Applications, limites et avancées » / “Anthracology WorldWide: diversity of contexts and environments. Applications, limits and advances”.
Porteur : Elysandre PUECH / archéobotanique / SJA3 - CEPAM / elysandre.puech@cepam.cnrs.fr
Mot clés : Anthracologie, Méthodologie, Paléobiodiversité, Paléoenvironnement.

Projet 3_3 : GERLI - 17th International GERLI Lipidomics Meeting : ‘’Lipids: from membrane dynamics to signaling’’ 
Porteur : Amri Ez-ZOUBIR / Bio / IBV - Gérard Lambeau / Bio / IPMC
Mot clés : Lipides, métabolisme et signalisation, nutrition, cancer, maladies métaboliques, inflammation, immunologie, microbiote, infection.

Projet 3_4 : 31CCI - 31è Colloque Canaux Ioniques
Porteur : Sylvie DIOCHOT / IPMC CNRS UMR7275
Mot clés : canaux ioniques, neurophysiologie, cardiologie, électrophysiologie, échange d’informations scientifiques (étudiants doctorants, post-doctorants, chercheurs).

Projet 3_5 : CRISPR-DAY - One Day Meeting : CRISPR Screening in Cancer Discovery
Porteur : Bernard MARI / IPMC
Mot clés : Crible CRISPR / Cas 9, Génomique Fonctionnelle, Cancérologie, Bioinformatique.

Projet 3_6 : BAW@UCA - Semaine du Cerveau sur la Côte d'Azur
Porteur : C Rovere et J Noël / IPMC
Mots clés : Cerveau, culture scientifique, partenaire UCA, interdisciplinarité.

Projet 3_7 : SDS#23 - Semaine du Son de l’Unesco NICE 2023
Porteur : Renaud DAVID / Santé / CHU NICE
Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement.

STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

Projet 2021_1
Kill_HIF - A novel antagonist of HIF-1alpha to target cancer.
Nathalie MAZURE DR2 CNRS / Bio / INSERM U1065, C3M / 1 Master.
Mohamed MEHIRI MCU HDR / Chimie / ICN / 1 Master.
Mots clés : Cancer, Inhibiteur, HIF-1, Hypoxie, Substances naturelles marines.

Projet 2021_2
RNP_IMAGE - Developing methodologies to quantitatively analyze RNP granule dynamic properties upon aging.
Florence BESSE / Biologie / iBV / 1 Master.
Xavier DESCOMBES / Informatique / INRIA / 1 Master.
Mots clés : biological condensates, RNP granules, high-resolution live imaging, automatic object detection, quantitative image analysis.

Projet 2021_4
Chemi_RNP - Optimisation de composés chimiques ciblant les granules à ARN.
Patrick BREST CRCN INSERM / Biologie / IRCAN / 1 Master.
Maria DUCA CRCN CNRS / Chimie / ICN / 1 Master.
Mots clés : Granules à ARN, Processing bodies, ribonucléoproteine, criblage chimique.

Projet 2021_5
PROoF - Comment protéger les forêts marines Méditerranéennes des poissons herbivores ? (PROtection of marine forests from herbivorous Fishes).
Luisa PASSERON-MANGIALAJO MCF HC HDR / Ecologie fonctionnelle / ECOSEAS / 1 Master.
Nathalie LAZARIC DR CNRS / Economie / GREDEG / 1 Master.
Mots clés : forêts marines, poissons herbivores, écologie chimique, changements de comportements des consommateurs, valorisation économique, gouvernance des écosystèmes, biens communs.

Projet 2021_6
AmpFluo3D - Solution innovante d’AMPlification de la FLUOrescence appliquée à la détection de marqueurs sur cultures cellulaires tridimensionnelles.
Frédéric BRAU IR HC CNRS / Biologie / IPMC / 1 Master.
Tatiana BUDTOVA DR / Physiques / Mines ParisTech / 1 Master.
Mots clés : Imagerie cellulaire, Culture 3D, Bio-aérogels, Polysaccharides, diffusion de la lumière, Fluorescence.
 

COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en Janvier 2021 au Laboratoire de Physio Médecine Moléculaire (LP2M), UMR7370 CNRS, Université Côte d’Azur, NICE, de la nouvelle équipe ATIP Avenir : TNT - Recherche Translationelle en Néphrologie et Transplantation.

L'équipe est dirigée par Antoine SICARD, MD, PhD
Praticien Hospitalier Universitaire du Service de néphrologie-dialyse-transplantation, Hôpital Pasteur II, CHU de Nice

Key words : kidney transplantation, antibody-mediated rejection, desensitization, immunotherapy, cell therapy, chimeric antigen receptor T cells
Website: http://unice.fr/lp2m/fr
 

ANIMATION SCIENTIFIQUE

Ces séminaires ont été reportées en 2021 pour des raisons de crise sanitaire due au CoViD-19.

Projet 3_2 : 31CCI - 31è Colloque Canaux Ioniques
Porteur : Sylvie DIOCHOT /  IPMC CNRS UMR7275
Mot clés : canaux ioniques, neurophysiologie, cardiologie, électrophysiologie, échange d’informations scientifiques (étudiants doctorants, post-doctorants, chercheurs)

Projet 3_3 : JMLC - 3rd Joint Meeting on Lung Cancer
Porteur : Paul HOFMAN / IRCAN INSERM CHU Hôpital Pasteur 1
Mots clés : Cancer du poumon, Biomarqueurs, OncoAge, MD Anderson

Projet 3_5 : SDS_2021 - Semaine du Son de l’Unesco NICE 2021
Porteur : Renaud DAVID / CMRR CHU Université Côte d’Azur
Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement

STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES

Projet 1_1 : ADOLYS - Adressage d’oncogènes au lysosome grâce à des molécules chimères de synthèse
Guillaume ROBERT / Biologie / C3M / 1 M2
Anthony MARTIN / Chimie / ICN / 1 M2
Mots clés : CMA, Molécule chimère, Lysosome, Oncogène, Hémopathies Myéloïdes, Ligation-Chimique, Bio-Conjugaison

Projet 1_3 : DARKtoLiGHT - Development of DRET-based fluorogenic probes for imaging of RNA subcellular distribution
Florence BESSE / Biologie / iBV / 1 M2
Benoît MICHEL / Chimie / ICN / 1 M2
Partenaires : Fabienne DE GRAEVE, Alain BURGER
Mots clés : Subcellular RNA localization, Compartmentalization, RNP granules, S/N ratio, fluorogenic probes, push–pull fluorophores, RNA detection, 2-photon imaging

Projet 1_4 : Hyp-ATACK - Hypusination targeting of cancer
Frédéric BOST / Biologie / C3M / M2
Mohamed MEHIRI / Chimie / ICN / M2
Partenaires : Victor TIROILLE, Kathiane LAURENT
Mots clés : Cancer, Hypusination, Substances naturelles marines, Composés de synthèse, Polyamines, Métabolomique

Projet 1_5 : TREAT-X – Identification of new therapeutics to treat Fragile X Syndrome and autism
Maria CAPOVILLA / Biologie / IPMC / M2
Maria DUCA / Chimie / ICN / M2
Partenaires : Barbara BARDONI, Marielle JARJAT, Audrey Di GIORGIO.
Mots clés : Fragile X Syndrome, therapy, RNA-binding, mass-spectrometry, blood-brain-barrier

Projet 1_6 : PRO-ZOOM – Impact of the PROton flux emitted by roots in the rhizosphere on ZOOspores Motion
Agnès ATTARD / Biologie / ISA INRAE / M2
Philippe THOMEN / Physique / INPHYNI / M2
Partenaires : Eric GALIANA; Joelle Le BERRE; Naïma MINET; Catherine MURA; Céline COHEN; Xavier NOBLIN
Mots clés : Microfluidic device, plant pathology, proton pumps, Arabidospis, zoospore motion, attraction, ionic gradient.

Projet 1_8 : MASCOT - Machine-learning et analyse des mouvements collectifs chez les trichogrammes
Louise VAN OUDENHOVE / Biologie / ISA INRAE / M2
François BREMONT / Informatique / INRIA / M2
Partenaires : Vincent CALCAGNO; Guy PEREZ; Monique THONNAT
Mots clés : Trichogramma; interactions sociales; mouvement collectif; intelligence artificielle; analyse d’images; algorithmes d’apprentissage

Projet 1_9 : SYNCHRO - Modélisation mathématique et outils expérimentaux pour l’étude du couplage intercellulaire entre oscillateurs circadiens de cellules périphériques
Madalena CHAVES / Informatique / INRIA / M2
Michèle TEBOUL / Biologie / iBV / M2
Partenaires : Firippi Eleni; Nicolas Augier; Delaunay Franck; Guérin Sophie; Monterosso Baptiste
Mots clés : Modèles linéaires par morceaux, couplage, synchronisation, oscillateur circadien

Projet 1_10 : SeizPred - Novel AI approach for seizure prediction in mouse models
Massimo MANTEGAZZA / Biologie / IPMC / M2
Marco LORENZI / Informatique / INRIA / M2
Partenaires : Fabrice DUPRAT, Fabrizio CAPITANO, Etrit HAXHOLLI, Carlo FANARA
Mots clés : Artificial intelligence algorithms, seizure prediction, epileptic encephalopathies, closed loop stimulation, risk modeling, time series analysis, therapeutic strategies

Projet 1_11 : LeftRightReliable - Reliable signalling in heterogeneous biological objects: The case of the zebrafish Left-Right Organizer
Maximilian FÜRTHAUER / Biologie / IBV / M2
Xavier DESCOMBES / Informatique / i3S INRIA / M2
Partenaires : Sophie POLES, Renaud REBILLARD
Mots clés : Left-Right asymmetry, Cell Signalling, Biological noise, Zebrafish
 

COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en Août 2020 à l’IPMC, SOPHIA ANTIPOLIS, d’une nouvelle équipe ATIP dirigée par 

Takeshi HARAYAMA, PhD, de l’UNIGE (SUISSE)

Projet : FACiL - Functions of Acyl-Chains in Lipid Membranes 

Objectifs
Search for the function of glycerophospholipids (GPLs) Acyl Chains at the molecular level in mammalian cells through two major projects :
Project 1: Molecular mechanisms linking linoleic acid-rich GPLs to adipogenesis.
Project 2: Relationship between acyl-chain asymmetry and phase separation.  

Mots clés : Membrane, Lipid, Adipocyte, Differentiation, Mesenchymal stem cells, CRISPR/Cas9, Phase separation, Lipid raft
Site Web : Métabolisme et fonctions des lipides membranaires

STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES
 

Projet 1 : MOORPHEUS - Modélisation computationnelle de la croissance et de l’organisation spatiale dynamique des organoïdes / tumoroïdes de prostate
Stephan Clavel / Bio / C3M INSERM / 1 Master
Xavier Descombes / Info / INRIA / 1 Master
Frédéric Bost/ Bio / C3M
Mots clés : Modélisation computationnelle, organoïdes, analyse d’image, simulation numérique, prostate,cancer, culture cellulaire  3D

Projet 2 : Sensaas - Sensitive surface as a shape : Calcul de la similarité moléculaire par comparaison de formes 3D à des fins de criblage virtuel
Dominique Douguet / Bio / IPMC CNRS / 1 Master
Frédéric Payan / Info / i3S UNS / 1 Master
Marc Antonini / Informatique / i3S UNS
Mots clés : Enveloppe moléculaire ; Similarité ; Criblage virtuel ; Recalage de nuages de points ; Apprentissage profond

Projet 4 : MCSPegylation - Entropic barriers to control protein movements at membrane contact sites
Bruno Antonny / Bio / IPMC CNRS / 1 Master
Alain Burger / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Instrinsically unstructured region, Membrane contact site, Click chemistry, Protein PEGylation

Projet 5 : PatchedChemoBio - Inhibition of Ptch1 chemotherapy resistance activity : cellular and chemical approaches
Isabelle Mus-Veteau / Bio / IPMC CNRS / 1 Master
Stéphane Azoulay / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Pharmacology, cellular biology, drug efflux pumps, chemotherapy resistance, medicinal chemistry

Projet 6 : PepLink - Structural features and biological significance of a conserved sequence that links two domains in a protein from a plant receptor family
Nadia Patino / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Harald Keller / BioAgro / ISA INRA CNRS / 1 Master
Mots clés : Plant, malectin, receptor, unfolded protein response, peptide analysis, transient expression

Projet 8 : ModeLInvasion - Modéliser l’invasion tumorale
Frédéric Luton / Bio / IPMC CNRS / 1 Master
Olivier Pantz / Maths / LJAD UNS / 1 Master
Mots clés : Invasion tumorale, forces mécaniques cellulaires, modélisation computationnelle, modèles cellulaires en culture 3D

Projet 9 : NeurObMCHR2 - Synthèse d’antagonistes du récepteur MCHR2 et validation dans des modèles cellulaires et de souris « humanisées »
Jean-Louis Nahon / Bio / IPMC CNRS / 1 Master
Véronique MICHELET / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Françoise Presse / Biologie/ IPMC
Mots clés : Comportement alimentaire, obésité, modèles de souris « humanisées », cerveau, neuropeptides, synthèse d’antagonistes du MCHR2, synthèse multi-étapes, méthodologies, synthèse asymétrique, catalyse

Projet 10 : CAVOBIOME - Rôle fonctionnel des poissons apogons dans les grottes méditerranéennes : étude du microbiome et écologie chimique
Cécile Sabourault / BioMarine / ECOSEAS CNRS UNS / 1 Master
Mohamed Mehiri / Chimie / ICN CNRS / 1 Master
Mots clés : Microbiome, poisson, chaine trophique, écologie chimique, antimicrobiens.

Projet 12 : MoBaMa - MOdélisation des interactions BActéries pathogènes-Macrophages
Laurent Boyer / Bio / C3M INSERM / 1 Master
Fernando Peruani / Maths / LJAD UNS / 1 Master
Mots clés : Modélisation, Mathématique, infection, bactéries, immunité innée, inflammasome

Projet 13 : SuperDynamicFun - Super-resolution Imaging of Organelle Dynamics in a Human Fungal Pathogen
Robert Arkowitz / Bio / iBV CNRS UNS / 1 Master
Laure Blanc-Feraud / Info / i3S CNRS INRIA / 1 Master
Sébastien Schaub / Bio / iBV CNRS UNS
Mots clés : Human fungal pathogen, super-resolution live cell microscopy, membrane compartment dynamics, temporal resolution

Projet 14 : HCAvis - Visualizing Human Cell Atlas
Pascal Barbry / Bio / IPMC CNRS / 1 Master
Marc Antonini / Informatique / INRIA / 1 Master
Mots clés : single cell, RNASeq, big data, data compression, image, biostatistics, deconvolution, airway epithelium diseases

Projet 15 : GENoise - Novel analysis framework to parse cell decision information from gene expression noise, applied to biomarker discovery of Cisplatin resistance in tumor cells
Jérémie Roux / Bio IRCAN CNRS / 1 Master
Frederic Cazals / Informatique INRIA / 1 Master
Mots clés : single-cell, cancer, machine learning, protein-protein interaction network, RNAseq, phenomics, data sciences, drug resistance
 

COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en 2019 à l’IRCAN, NICE, d’une nouvelle équipe senior dirigée par Miguel Godinho FERREIRA, DR2 CNRS de Instituto Gulbenkian de Ciência, OEIRAS, PORTUGAL
Projet : TeloAge - Telomere shortening as a cause for age-related cancer incidence 
Mots clés : Aging; Cancer, Melanoma; Telomerase; Telomeres; Zebrafish
https://www.ircan.org/en/research/miguel-godinho-ferreira

ANIMATION SCIENTIFIQUE DE L'ACADEMIE 4


Sélection de JUIN 2019

Projet 1 : BioRegul - 4ème école jeunes chercheurs - Modélisation Formelle de Réseaux de Régulation Biologique.
École d’été en Modélisation pour la biologie des systèmes.
Porteur : COMET Jean-Paul / Info / i3S CNRS
Mots clés : Biologie des systèmes, réseaux génétiques, réseaux métaboliques, réseaux de signalisation, systèmes dynamiques, modélisation formelle, modèles prédictifs, cycle expérimentation-modélisation.
Cofinancement : Académies 1, 2 et 3.

Projet 2 : Entom19 - Le colloque des Entomophagistes, édition 2019.
Colloque avec conférencier invité.
Porteur : Van OUDENHOVE Louise / BioAgro / ISA INRA
Mots clés : Colloque scientifique, insectes, parasitoïdes, prédateurs, biodiversité, lutte biologique.

Projet 3 : 30CCI - 30e colloque Canaux ioniques.
Colloque avec conférenciers invités.
Porteur : DIOCHOT Sylvie / Bio / IPMC CNRS
Mots clés : Canaux ioniques, neurophysiologie, cardiologie, formation des étudiants en électrophysiologie, échange d’informations scientifiques (étudiants en thèse, postdoctorants, chercheurs).

Projet 4 : IPMC2019 - IPMC : 30 ans de biologie en Côte d’Azur.
Colloque scientifique.
Porteurs : CHAMI Mounia et SZMIDT Simon / Bio / IPMC CNRS
Mots clés : Biologie, interdisciplinarité, recherche fondamentale, Université Côte d’Azur, IPMC.

Projet 5 : Nice-seq seminar series - Nice-seq: a genomic forum of the Nice bay area.
Seminar series.
Porteur : LITI Gianni / Bio / IRCAN
Mots clés : genomics, bioinformatics, computational biology, quantitative biology, adaptive evolution.

Projet 6 : ICMA19 - Imaging in Cancer : multimodal analyzes.
One day symposium
Porteur : HUEBER Anne-Odile / Bio / iBV UNS.
Mots clés : Imaging, cancer, digital pathology, artificial intelligence, diagnostics.

Projet 7 : INC2020 - International Congress of Nematology.
International conference
Porteur : ABAD Pierre / BioAgro / ISA INRA
Mots clés : Nematology, Parasitology, Genomics, Physiology, Ecology, Biocontrol, Management.

Projet 8 : Aquavity - Aquatic research models to study regeneration and aging - Assessing aging in long-living, potentially immortal, aquatic animals.
Colloque
Porteur : ROTTINGER Eric / Bio / IRCAN
Mots clés : Longévité, Régénération, Modèles aquatiques, Biologie comparative.


Sélection de DECEMBRE 2019

Projet 2 : SDS - Semaine du Son 2020.
Série de séminaires scientifiques et grand public sur 2 semaines
Porteur : Renaud DAVID / Médecine / CHU NICE
Mots clés : Son, musique, cerveau, audition, créativité, surdité, émotions, environnement, société.

Projet 3 : CJM2020 - Genetics, Environment, Signalling & Synaptic Plasticity in Developmental Brain Disorders : from Bench to Bedside.
Organisation d'une conférence Jacques MONOD
Reporté pour cause d'épidémie de COVID19 en Mai 2021
Porteur : Barbara BARDONI / Bio / IPMC
Mots clés : Neurodevelopment, signaling, genetics, genomics, therapy.

Projet 4 : DemosResolution - Démocratisons la Super-résolution! / Expand your super-resolution mind!
Atelier Recherche / Formation avec conférenciers invités
Porteur : Frédéric BRAU / Bio / IPMC
Mots clés : Super résolution, SRRF, STED, Expansion microscopy.
Cofinancement : Académie 2

Projet 5 : DynaProt - Dynamique des membranes et des protéines membranaires.
Aide au Montage d'un projet collaboratif de Formation par la Recherche ERASMUS+ /
Porteur : Delphine BICHET / Bio / IPMC
Mots clés : Formation/recherche, Master SVS, programme Erasmus+, dynamique des membranes, protéines membranaires, canaux ioniques
 

THESE INTERDISCIPLINAIRE

Financement d'une thèse interdisciplinaire 2019-2020 préparé par Melody SUBRA
Projet : Architecture fonctionnelle et dynamique des sites de contact membranaire impliquant OSBP
Accueil : Drs Bruno MESMIN et Bruno ANTONNY (IPMC)
 

STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES


Projet 1 : EPI-ANALYSE - Développement d'outils de détection efficace des crises d'épilepsie chez la souris par analyse d'image et de signal EEG
Porteur 1 : F Duprat / Biologie / IPMC / 1 Master
Porteur 2 : T Papadopoulo / Info / INRIA / 1 Master
Mots clés : Epilepsie, modèles animaux, crise, analyse, image, vidéo, EEG, épileptogenèse, algorithme, interictal

Projet 2 : VIF-APAS - Vieillissement, Immuno-métabolisme et Fragilité : effets d'un Programme d’Activités Physiques Adaptées à des fins de Santé.
Porteur 1 : AS Rousseau / Biologie / C3M / 1 Master
Porteur 2 : R Zory / Sport / UNS LAMHESS / 1 Master
Mots clés : Immunité, Fragilité, Activités Physiques Adaptées, Vieillissement.

Projet 3 : NutriMorph - Lipides nutritionnels et remodelage cérébral: mesure de la plasticité gliale grâce à un outil de morphométrie cellulaire.
Porteur 1 : C Rovère / Biologie / IPMC / 1 Master
Porteur 2 : E Debreuve / Info / i3s INRIA/ 1 Master
Mots clés : Traitement de l'obésité, lipides nutritionnels, neuroinflammation, hypothalamus, astrocytes, microglie, plasticité cellulaire, analyse d'images, structures linéiques, extraction de caractéristiques, morphologie, topologie, classification non supervisée.

Projet 4 : CAID - Cibler conjointement et l’Angiogénèse et l’Inflammation dans la forme humide de la Dégénérescence maculaire liée à l’âge (DMLA).
Porteur 1 : S Martial / Chimie / ICN / 1 Master
Porteur 2 : L Demange / Biologie / IRCAN / 1 Master
Mots clés : Angiogenèse ; Inflammation ; DMLA; anticorps bispécifiques; chimie médicinale

Projet 5 : GIfTED - Synthetic small molecules inducing the differentiation of glioblastoma initiating cells: new perspectives in cancer chemotherapies.
Porteur 1 : M Duca / Chimie / ICN / 1 Master
Porteur 2 : T Virolle / Biologie / INSERM iBV / 1 Master
Mots clés : Chemistry, biology, cancer stem cells, tumor, miRNA, small molecular compounds, therapy

Projet 6 : ModHyMet - Modélisation hybride du métabolisme cellulaire.
Porteur 1 : JP Comet / Info / i3s UNS EPU / 1 Master
Porteur 2 : F Delaunay / Biologie / iBV / 1 Master
Mots clés : Métabolisme cellulaire, imagerie, cellule unique, modélisation hybride de réseaux métaboliques, méthodes formelles.
 

COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION D'UNE NOUVELLE EQUIPE DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Installation en 2018 à l’IBV, NICE, d’une nouvelle équipe ATIP/Avenir  dirigée par 

Bruno HUDRY (CR CNRS) 

de MRC Clinical Sciences Centre, LONDON, UK.
Site Web : http://ibv.unice.fr/research-team/hudry/
 

ANIMATION SCIENTIFIQUE DE L'ACADEMIE 4


LES CONFERENCES 2018

Projet 1 : 29CCI - 29ème colloque Canaux Ioniques
Colloque avec conférenciers invités.
Porteur : R Rapetti-Mauss / iBV

Projet 2 : BAW@UCA - Semaine du Cerveau sur la Côte d'Azur
Série de conférences pour la culture scientifique.
Porteur : C Rovere et J Noël / iPMC



LES PROFESSEURS INVITES 2018

Projet 3 : MycoPain - AT2R-TRAAK-Bioanalgesics
Invitation du Pr Felix Viana, tenure investigator, instituto de neurociencias, UMH-CSIC (SPAIN) pour une collaboration de recherches scientifiques.
Porteur : G Sandoz / iBV
Mots clés : Pain, Mycolactone, ion channels, CGPR. 

Projet 4 : CattChannel - Invitation du Prof. W Catterall, Department of Pharmacology, University of Washington, SEATTLE, WA, USA.
Professeur invité, expert en "channelopaties".
Porteur : M Mantegazza / IPMC.

 

FINANCEMENTS D'INFRASTRUCTURES PARTAGEES

Après soumission à l’évaluation du conseil scientifique et à la validation du comité de pilotage, l’Académie 4 a financé en 2018 un projet collaboratif de 3 laboratoires avec un ingénieur dédié pendant 1 an et un budget de 110 k€.

Projet : MUTIMAGE_UCA - mise en place d’infrastructures et d’équipements fédérateurs (au fil de l’eau).
Porteur 1 : Frédéric BRAU, IRHC CNRS UMR 7275, IPMC
Porteur 2 : Faisal BEKKOUCHE, IE1 CNRS UMR 7009, Institut de la Mer de Villefranche
Porteur 3 : Robert ARKOWITZ, DR1 CNRS UMR 7277, IBV

Objectifs: fournir une base informatique fonctionnelle (OMERO) à tous les laboratoires des sciences de la vie azuréens pour faciliter la gestion, le partage et l’analyse des images biologiques pour promouvoir et stimuler l’analyse quantitative des données. La base a été mise en place en partenariat avec l'Institut Français de BioInformatique (ifb) et a été étendue à l'ensemble des stations marines membres de l'EMBRC France.
 

STAGES ENVIRONNES DE MASTER EN BINOMES INTERDISCIPLINAIRES


Projet 1 : FMRP-SUMO-ABS - Impacts atomiques et cellulaires des modifications par SUMO de la Fragile-X Mental Retardation Protein
Porteurs : C Gwizdek / Biologie / IPMC - F Cazals / Info / INRIA 

Projet 2 : MecanoAdipo - Modeling the mechanical feedback of adipogenesis
Porteurs : E Honore / Biologie / IPMC - B Mauroy / Maths / LJAD - JF Tanti / Biologie / C3M

Projet 4 : IDEX_MITO - Détection, classification et caractérisation de réseaux mitochondriaux : application à la maladie d’Alzheimer et au cancer
Porteurs : X Descombes / Info / INRIA - M Chami / Biologie / IPMC - F Bost / Biologie / C3M

Projet 6: I2MD - Identification of inhibitors disrupting MITF interactions with DNA
Porteurs : A Burger / Chimie / ICN - C Bertolotto / Biologie / C3M

Projet 7 : REDAC - Recherche et caractérisation de drogues anti-invasion cancéreuse
Porteurs : M Franco / Biologie /  IPMC - M Mehiri / Chimie / ICN

Projet 8 : DEMOTECH - Développement de molécules pour la thérapie des hémopathies chimiorésistantes
Porteurs : A Martin / Chimie / ICN - G Robert / Biologie / C3M - T Cluzeau / Médecine / Hématologie clinique du CHU de Nice

Projet 9 : COMICS - Identification de composés immuno-stimulateurs antimicrobiens de nouvelle génération
Porteurs : T Michel / Chimie / ICN - L Boyer / Biologie / C3M

Projet 8 : mTRANS - Role of distance and energy in vectorial lipid transport
Porteurs : G Drin / Biologie / IPMC - A Seminara / Physique / INPHYNI

Projet 9 : mMpH - Fast measurements of intracellular pH using microfuidic systems
Porteurs :  L Counillon / Biologie / LP2M -  X Noblin / Physique / INPHYNI 

Projet 10 : NMLA-scRNASEQ - New machine learning approaches for single cell RNA seq analysis
Porteurs : A Paquet / Biologie / IPMC - M Barlaud / Info / I3S
 

COFINANCEMENT DE L'INSTALLATION DE NOUVELLES EQUIPES DE RECHERCHE A L'UNIVERSITE COTE D'AZUR

Deux jeunes équipes ATIP/Avenir se sont installées à l'Institut de Biologie de Valrose (iBV) depuis Juin 2016.

1- Equipe ATIP/Avenir installée à l'iBV dirigée par Arnaud HUBSTENBERGER (CR1 CNRS) de l'UPMC PARIS (FRANCE), reçu au concours CNRS en juin 2016.
http://ibv.unice.fr/research-team/hubstenberger/

2- Equipe ATIP/Avenir installée à l'iBV dirigée par Matteo RAUZI  (CR1 CNRS) de l'EMBL HEIDELBERG (GERMANY), reçu au concours CNRS en juin 2017.
http://ibv.unice.fr/research-team/rauzi/
 

ANIMATION SCIENTIFIQUE DE L'ACADEMIE 4


Projet 1 : ONCOAGE_MD ANDERSON - 2nd symposium ONCOAGE-MD ANDERSON: 1st joint meeting on lung cancer
Colloque avec conférenciers invités.
Porteur : P Hofman (CHU Nice)

Projet 2 :  CFC-2017 - 10ème meeting cils, flagelles et centrosomes, 2017
Colloque avec conférenciers invités.
Porteur : L E Zaragosi-Rathelot (IPMC)

Projet 3 : NICE RNA 2018 - The multiple facets of RNA in health and disease
Colloque avec conférenciers invités.
Porteur : B Mari (IPMC)

Projet 4 : COLT - Colloque sur le temps
Colloque avec conférenciers invités.
Porteur : A GUYON (IPMC)

Projet 5 : CareerEXPO2018 - CareerEXPO2018 is an annual exchange and networking event for PhD candidates and young researchers along with industry professionals.
Colloque avec conférenciers invités.
Porteur : association IGBio de l'Ecole Doctorale SVS85 (LPMM, IRCAN, IPMC, LABEX SignaLife, ICST, DISTALZ, UNS)
Comité d'organisation étudiant : Auréa COPHIGNON / LP2M - Tomás DE GARAY / IRCAN - Sanya Eduarda KUZET / IRCAN - Racha Fayad  / IPMC

Projet 6 : APHA - Accueil Pr Heinz Arnheiter, MD, scientifique émérite
Professeur invité avec conférences dispensées.
Porteur : C Bertolotto (C3M)